mBio：年夜范围病例研讨标明新冠病毒渐变D614G能够让这种病毒更具沾染性

2020年11月12日讯/BIOON/---在一项新的触及美国休斯敦市5000多名COVID-19患者的研讨中，来自美国休斯顿卫理公会病院、威尔康乃尔医学院和德克萨斯州年夜学奥斯汀分校等研讨机构的研讨人员发明招致COVID-19疾病的SARS-CoV-2冠状病毒正在积聚基因渐变，个中的一种基因渐变使得这种病毒更具沾染性。这种称为D614G的渐变位于SARS-CoV-2的刺突卵白（S卵白）中，这种S卵白撬开我们的细胞，从而让这种病毒进入。这是迄今为止在美国的一个年夜都会地域展开的最年夜的关于SARS-CoV-2基因组序列的同业评审研讨。相干研讨成果近期揭橥在mBio期刊上，论文题目为“Molecular Architecture of Early Dissemination and Massive Second Wave of the SARS-CoV-2 Virus in a Major Metropolitan Area”。

图片来自mBio, 2020, doi:10.1128/mBio.02707-20。 论文配合作者、德克萨斯州年夜学奥斯汀分校分子生物迷信副传授Ilya Finkelstein说，这篇论文显示“因为中性漂移（neutral drift）---这只是意味着不协助或损害SARS-CoV-2的随机基因变更---以及来自我们免疫零碎的压力，这种病毒正在积聚渐变。”

在COVID-19年夜风行的最后一波时代，在休斯敦患者中发明的新型冠状病毒中，有71%的病毒具有这种渐变。当冬季第二波疫情袭击休斯登时，这一数字跃升至99.9%。这反应了活着界各地不雅察到的一种趋向。本年7月揭橥的一项基于2.8万多个基因组序列的研讨发明，携带D614G渐变的变体在一个月阁下的工夫里成为SARS-CoV-2的全球主导方式（Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.06.043）。那么，为什么含有这种渐变的SARS-CoV-2毒株会打败那些没有这种渐变的毒株呢？

也许是它们的沾染性更强。英国一项对超越25000个基因组序列的研讨发明，具有这种渐变的SARS-CoV-2病毒在传达速度方面往往比没有这种渐变的病毒稍快，并形成更年夜范围的沾染（medRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.07.31.20166082）。天然选择会偏好于更轻易传达的SARS-CoV-2毒株。但并不是一切迷信家都信任这一点（Nature, 2020, doi:10.1038/d41586-020-02544-6）。一些人提出了另一种说明，称为“开创者效应（founder"s effect）”。在这种情形下，D614G渐变能够在第一批达到欧洲和北美的病毒中更罕见，根本上使得它们比其他的毒株有了先机。

SARS-CoV-2的S卵白还在持续积聚意义不明的额定渐变。这些研讨人员还在试验室试验中发明，至多有一种如许的渐变可以让S卵白回避人类天然发生的用于对立SARS-CoV-2沾染的中和抗体。这能够会让这种病毒的变体更轻易从我们的免疫零碎中溜走。固然今朝还不清晰它能否会转化为也更轻易在人体之间传达的毒株。

好新闻是这种渐变是罕有的，似乎不会让沾染患者的疾病更严重。依据Finkelstein的说法，他们没有不雅察到曾经学会回避第一代疫苗和医治性抗体配方的SARS-CoV-2病毒。

Finkelstein说，“这种病毒活着界暴虐时持续产生变异。像我们的研讨如许的及时监测任务将确保全球疫苗和医治办法一直抢先这种病毒一步。”

这些研讨人员留意到，在数千例沾染中共有285种渐变，不外年夜多半渐变似乎对这种疾病的严重水平没有严重影响。今朝正在停止的研讨会持续查询拜访第三波COVID-19患者，并肯定这种病毒若何顺应我们免疫零碎发生的中和抗体。每一次新的沾染都是一次掷骰子，也是发生更风险渐变的额定机遇。

论文通信作者、休斯顿卫理公会病院的James Musser说，“我们曾经给了这种病毒好多机遇。现在，沾染人群范围很年夜。”

德克萨斯州年夜学奥斯汀分校的其他作者也为这项研讨作出了奉献：拜访学者Jimmy Gollihar，分子生物迷信副传授Jason S. McLellan和研讨生Chia-Wei Chou，Kamyab Javanmardi和Hung-Che Kuo。

这些来自德克萨斯州年夜学奥斯汀分校的研讨人员测试了这种病毒S卵白的分歧基因变体，以测量这种卵白的波动性，并懂得它与宿主细胞上的受体和中和抗体的联合情形。本年早些时分，McLellan和他在德克萨斯州年夜学奥斯汀分校的团队与美国国度卫生研讨院的研讨人员协作，开辟了第一个关于SARS-CoV-2 S卵白的三维图谱，这项立异现在已被使用到几种次要候选疫苗的设计中。

这些研讨人员发明，SARS-CoV-2从分歧的地舆区域自力地屡次传入休斯敦地域，病毒毒株来自欧洲、亚洲、南美和美国其他地域。在休斯顿申报COVID-19病例后不久，这种病毒就呈现了普遍的社区传达。（100医药网 100yiyao.com）

参考材料：

1.S. Wesley Long et al. . mBio, 2020, doi:10.1128/mBio.02707-20.

2.Coronavirus mutation may have made it more contagious: study

https://medicalxpress.com/news/2020-10-coronavirus-mutation-contagious.html

3.Erik M Volz et al. . medRxiv, 2020, doi:10.1101/2020.07.31.20166082.

4.Bette Korber et al. . Cell, 2020, doi:10.1016/j.cell.2020.06.043.

5.Ewen Callaway. . Nature, 2020, doi:10.1038/d41586-020-02544-6.

6.COVID-19 Vaccine Candidate with UT Ties Arrived Quickly After Years in the Making

https://cns.utexas.edu/news/covid-19-vaccine-with-ut-ties-arrived-quickly-after-years-in-the-making