喷鼻港理工年夜学副传授Gilman Kit Hang Siu 研讨团队：纳米孔测序剖析喷鼻港第三波疫情或由外埠输出

7月初起，中国喷鼻港特区呈现第三波新冠病毒年夜范围传达。7月底，喷鼻港文报告请示、轻旧事、icable TV、now TV等多家媒体报道：喷鼻港理工年夜学副传授Gilman Kit Hang Siu（萧杰恒）研讨团队基于孔测序技巧，对26名病人病毒样本停止SARS-CoV-2溯源研讨，发明确诊沾染者体内的病毒株属同类（“G型病毒株”的变种“GR型病毒株”）存在巨大差别，提醒出喷鼻港第三波疫情很能够是由输出型个案惹起，在喷鼻港演化出多条传达链：个中一条传达链的病毒基因序列简直如出一辙（触及19名确诊者样本），年夜都触及年夜范围沾染群体，且笼罩喷鼻港多区；另一条传达链位于喷鼻港铜锣湾一带；第三条传达链则触及喷鼻港西贡某村居平易近，今朝暂未找到泉源。

3月，GilmanKit Hang Siu传授应用孔测序，对2月底喷鼻港50名患者样本（占总病例53.8%）停止全基因组测序和风行病学剖析，以协助肯定COVID-19在喷鼻港当地的传达退化速度和工夫，零碎发育剖析标明：42例病毒序列(84.0%)聚成6簇，44例（88%）产生罕见渐变Orf3a G251V，这与与风行病学查询拜访分歧。与全球的病毒序列停止零碎发育树比对剖析还显示，喷鼻港年夜部门病例(88.0%)与来自其他国度的毒株集合在两个分支。COVID-19在喷鼻港迸发的比来配合祖先(tMRCA)的工夫估量为2019年12月24日，退化率为3.04x103/位点/年，2020年2月28日的再生系数为1.84，为喷鼻港的病毒退化溯源、病毒变异、风行病学调研和防控等供给根据。研讨结果揭橥在预印版杂志《medRxiv》上：(100yiyao.com）

【直播预告】孔测序在人类学和罕有病研讨中的使用

【日期】2020/11/19 15:00