细胞图谱最新研讨停顿

2020年12月28日讯/100医药网BIOON/---细胞图谱在说明包含人类在内的哺乳植物的各类组织和器官的作用机制方面起侧重要作用。深化相识这些组织和器官在安康和患病时的细胞图谱，有助于开辟新的疗法。针对细胞图谱的最新停顿，小编进行一番梳理，以飨读者。

1.

doi:10.1038/s41586-020-2922-4

在一项新的研讨中，来自美国斯坦福年夜学的研讨职员构建出人类肺部的细胞图谱，该细胞图谱突出了组成肺部分歧部门的几十种细胞类型。相关研讨成果于2020年11月18日在线颁发在Nature期刊上，论文题目为“A molecular cell atlas of the human lung from single-cell RNA sequencing”。在这篇论文中，他们描写了他们的研讨任务（次要波及单细胞RNA测序）以及他们在研讨任务中相识到的一些对于肺部的事情。

图片来自CC0 Public Domain。 为了构建肺部细胞图谱，这些研讨职员从肺部的细支气管、支气管和肺泡区域搜集了组织样本，以及相关的血液样本。每一个样本都被分化成其细胞身分，然后按类型进行分类：免疫细胞、上皮细胞、内皮细胞或基质细胞。

这些研讨职员为年夜约75000个细胞天生了转录组。通过使用标记物，他们随后对这些细胞进行了聚类阐发，提醒了58个分歧的细胞群体。在如许做的进程中，他们可能天生91%的肺部细胞类型的表白谱，并且还发现了14种曩昔不为迷信所知的肺部细胞类型。他们还发现了年夜约200种标记物，可以用来辨认他们发现的未知肺部细胞类型。

2.

doi:10.1126/science.aba7721; doi:10.1126/science.aba7612

在两项新的研讨中，来自美国华盛顿年夜学医学院和布罗特曼-巴蒂精准医学研讨所等研讨机构的研讨职员构建出两个细胞图谱，用于追踪人类细胞类型和组织发育进程中的基因表白和和染色质可及性（chromatin accessibility，也译为染色质可拜访性）。此中的一个细胞图谱绘制了15种胎儿组织中单个细胞内的基因表白，另一个细胞图谱绘制了这些细胞内单个细胞的染色质可及性。相关研讨成果颁发在2020年11月13日的两篇Science论文中，论文题目别离为“A human cell atlas of fetal gene expression”和“A human cell atlas of fetal chromatin accessibility”。

这些图谱独特为相识人类发育进程中的基因表白和染色质可及性提供了规模绝后的根底资本。此外，这两篇论文中描写的技术使得天生数百万个细胞的基因表白和染色质可及性数据成为能够。

在第一项研讨中，为了创立基因表白图谱，这些研讨职员通过使用一种名为 sci-RNA-seq3 的技术，对 15 种胎儿组织的基因表白进行了剖析。这种技术为每个细胞贴上了三个DNA条形码的共同组合标签，从而使得他们可能在不进行物理拆散的环境下跟踪这些细胞。

在这些得到DNA条形码序列后，他们使用盘算机算法得到单细胞信息，按细胞类型和亚型对细胞进行聚类，并确定它们的发育轨迹。他们对400多万个单细胞进行了剖析，确定了77种次要的细胞类型和年夜约650种细胞亚型。

在第二项研讨中，为了剖析单个细胞中的DNA可及性，这些研讨职员开辟了一种新的办法，称为 sci-ATAC-seq3。与 sci-RNA-seq3 一样，这种技术也是在每个细胞中使用三个分歧的 DNA “条形码”来标志和追踪单个细胞。然而，sci-ATAC-seq3并不辨认一切以后表白的序列，而是捕获开放的染色质位点并进行测序。

在这项新的研讨中，这些研讨职员在15种胎儿组织的年夜约100万个位点上天生了近80万个单细胞染色质可及性数据。他们研讨了哪些卵白能够与每个细胞中的可拜访DNA位点互相作用，以及这些互相作用若何解释细胞类型。这一阐发确定了基因组内的发育节制开关。他们还确定了能够与疾病相关的染色质可拜访性位点。

3.

doi:10.1038/s41586-020-2797-4

在一项新的研讨中，来自美国哈佛医学院、布莱根妇女病院、英国韦尔科姆基金会桑格研讨所、伦敦帝国理工学院和德国马克斯-德尔布吕克分子医学中间等研讨机构的研讨职员构建出安康的人类心脏的具体细胞和分子图谱，以相识这一紧张器官若何发扬功效并说明血汗管疾病的成绩地点。相关研讨成果于2020年9月24日在线颁发在Nature期刊上，论文题目为“Cells of the adult human heart”。

这些作者阐发了近50万个细胞，树立了迄今为止最全面的人类心脏细胞图谱。该图谱显示了细胞的微小多样性，并提醒了心肌细胞类型、心脏维护性免疫细胞和扑朔迷离的血管网络。它还预测了这些细胞若何进行交流以坚持心脏正常任务。