Nat Methods：迷信家开辟出了一种新办法 或能使便携式PCR测序仪到达近乎完满的精确性

2021年1月18日 讯 /100医药网BIOON/ --近日，一篇登载在国内杂志Nature Methods上的研讨申报中，来自英属哥伦比亚年夜学等机构的迷信家们通过研讨发现了一种复杂的办法，可能打消普遍使用的便携式DNA测序仪所发生的简直一切测序差错，从而就能帮忙在试验室外任务的迷信家们加倍无效地研讨并追踪SARS-CoV-2等病原微生物。

使用特别的分子标志，研讨职员就能将牛津纳米孔技术公司临盆的MinION设备的5%-15%的差错率下降到0.005%以下；即便进行一次多种长链的DNA测序时也是如斯。研讨者Ryan Ziels传授说道，MinION将DNA测序从年夜型试验室的限定中束缚了进去，彻底改动了基因组学畛域的相关研讨。但直到当初，因为存在相称高的“开箱”差错率，研讨职员并不克不及在好多环境下依赖于该设备。

图片起源：Pixabay/CC0 Public Domain

基因组测序可能提醒一个无机体的多种信息，包含其身份、祖先、劣势和弱点；迷信家们能应用这些信息来更好地舆解栖身在特定情况中的微生物，并开辟响应的诊断对象和医治性伎俩；然而，要是没有准确的便携式DNA测序仪，迷信家们在朝外或小型试验室中进行研讨时就很容易疏忽症结的基因细节信息。这项研讨中，研讨职员开辟出了一种特别的条形码体系，其能像MinION设备设备一样使得长读取DNA测序平台的精确率可能进步1000倍以上，当应用这些条形码来标志靶向性分子时，研讨职员依照通常的做法，使用尺度的PCR技术可能扩增或制作标志分子的多个拷贝，同时还能对所获得的的DNA进行测序。

随后研讨职员使用这种条形码体系轻松辨认而且对测序数据中的相关PCR片断进行了分组，终极从这些片断中发生了近乎完满的序列，其长度可能到达传统技术处置光阴的10倍左右，并且更长的DNA长度还可能对轻细的遗传渐变进行检测，并能完成基因组的高分辩率组装。

研讨者Ziels说道，这种办法的利益在于其实用于任何可以扩增的基因片断；这就象征着，其在任何能将有代价的高精确率和长程基因组信息进行组合的任何畛域都十分无效，比方癌症研讨、动物研讨、人类遗传学研讨和微生物组研讨等。今朝研讨职员愿望能通过结合研讨开辟出一种扩大版的办法，并能对饮用水和废水中的微生物完成及时检测；要是能对水体系中的微生物进行深化相识，社区或者就可能改善其公共安康战略和医治技术，同时也可能更好地节制诸如SARS-CoV-2等无害病原体的传达和扩散。（100医药网100yiyao.com）

原始出处：

Karst, S.M., Ziels, R.M., Kirkegaard, R.H. et al. . Nat Methods (2021). doi：10.1038/s41592-020-01041-y