研讨颁布水生动物莲的基因组遗传变异与表白数据库

莲为水生动物，俗称荷花（莲科莲属），莲的来源较早，对研讨被子动物（有花动物）的来源与演变具备紧张的指导意义。在理论临盆中，莲花样、花型丰厚多样，且赋予了特别的文明内在，在园林景观中利用普遍；兼具食用、药用等紧张代价，引发学界存眷。基于此，中国迷信院武汉动物园水生动物生物地舆学学科组与武汉市园林迷信研讨院科研职员单干，构建了莲的基因组变异与表白数据库Nelumbo Genome Database（NGD）。

NGD部署了我国古代莲基于HI-C技术的染色体程度基因组组装序列，收录了正文到的150，589个mRNA转录本异构体和34，481个具备完全开放浏览框的基因，为破解莲分子遗传机理提供了“症结钥匙”。该数据库整合了公共数据库中莲的11个组织在分歧时期的共63个转录组基因表白数据，并构建了加权基因共表白网络，涵盖了分歧器官（组织）类型发育调控以及统一组织分歧发育调控进程中协同表白的基因模块（module），为相识莲的基因表白调控纪律提供了紧张的公共阐发平台。此外，该数据库还对荷花中具备代表性的88个栽培种表型性状进行了数字化，并基于试验室外部及此前已颁发的基因组重测序数据，响应鉴定了26，939，834个高质量单核苷酸多态性变异位点和4，177，974个拔出缺失变异位点，丰厚了莲的变异信息。该数据库部署了包括Blast、Gbrowse、Primer Design和Expression Visualization在内的多个对象，使莲的基因序列、功效及表白的相关信息更易获取。该公共数据平台为开展莲的基因组退化、分子和分子育种等畛域的研讨及试验设计提供了参考信息。 (100yiyao.com）