检测DNA甲基化维持效率的办法研讨取得停顿

中国迷信院生物物理研讨所研讨员朱冰课题组在Nature Protocols上，在线颁发了以Simultaneously measuring the methylation of parent and daughter strands of replicated DNA at the single-molecule level by Hammer-seq为题的研讨论文。

在以往任务中（Ming et al.， Cell Research. 2020），朱冰课题组为研讨复制叉事后DNA甲基化维持的动静进程以及调控机制，开辟了Hammer-seq（Hairpin-assisted ming of methylation of replicated DNA）。该办法联合了EdU（胸腺嘧啶相似物）标志新合成DNA链、点击化学反馈在EdU位点增加biotin标签、Streptavidin亲和纯化和Hairpin全基因组DNA甲基化测序等技术，可能在DNA复制的分歧时期，同时检测亲链和子链的DNA甲基化状态，进而可以研讨DNA甲基化的维持动静及其调控机制。在Hammer-seq的开辟进程中，该办法也在该课题组和清华年夜学传授颉伟课题组的一项单干任务中获得了利用（Wang et al.， Nat Genet. 2020）。

为拓展Hammer-seq的利用范畴，科研职员具体描写了Hammer-seq的设计思绪、开辟进程、试验步调、优点和缺陷等，瞻望了Hammer-seq潜在的利用场景，此中包含：解析复制叉事后新合成DNA链的甲基化维持速度；检测甲基化维持进程中随同产生的从头甲基化变乱；联合渐变细胞系的构建，解析响应基因在调控甲基化动静维持进程的作用机制等。此外，简化版的Hammer-seq还可用于构建Hairpin全基因组DNA甲基化测序文库，且相比于原无方法加倍地简练和易于操作。(100yiyao.com）