Nature：三阴性乳腺癌随肿瘤成长会积聚基因变异

2021年3月25日讯/100医药网BIOON/---依据比来一项研讨，得克萨斯年夜学MD安德森癌症中间的研讨职员引导的一个小组降服了单细胞DNA（scDNA）测序的技术挑战，开辟了一种以单分子分辩率进行scDNA测序的新办法。这项技术初次提醒了三阴性乳腺癌在染色体不稳定的最初暴发后阅历了间断的基因拷贝数变动。 这项发现颁发在《Nature》杂志上，为对数百种癌细胞进行测序提供了一种精确而无效的新办法，同时也为癌症的倒退提供了新颖的见解。这些见解可以解释为什么医治并不老是无效的，以及为什么研讨职员不克不及在试验室中发生同质化的细胞培育物。

文章作者，遗传学，生物信息学与盘算生物学副传授Nicholas Navin博士说：“这代表了咱们在单细胞DNA测序中的第一种办法的严重停顿，显著进步了通量，精确性和易用性。咱们当初可能以曩昔不行能的方式解决肿瘤细胞群体内拷贝数的巨大差别。”

这项新技术被称为“声细胞标签化（ACT）”，从荧光激活的细胞分选开端，以从数千个细胞中拆散出单个细胞核。然后通过三步化学进程将每个细胞中的DNA切割成准确的片断，增加通用接头并联合条形码以进行下一代测序。

化学进程是通过声学液体传输技术执行的，该技术使用声波疾速无效地传输微量液体。 Navin解释说，晚期的scDNA测序办法从开端到停止必要三天的光阴，而新的办法可以在三小时内实现。

（图片起源：Www.pixabay.com） 通过这种改良的办法，可以对无限数目的细胞中的DNA进行测序，研讨职员试图答复无关癌症退化的一个常设成绩。Navin研讨小组先前研讨成果显示，三阴性乳腺癌会阅历标点退化，在染色体不稳定的初始暴发中得到拷贝数变动，然则癌细胞在此变乱之后是否持续积聚变动仍然未知。

在研讨生Darlan Conterno Minussi的率领下，Navin的团队与Dana-Farber癌症研讨所的Franziska Michor博士的试验室单干，使用ACT技术对来自八种三阴性乳腺癌和四种细胞系的16178个单细胞进行了拷贝数阐发。

Navin说：“咱们发现这些细胞中的标点退化随同着长久的不稳定。在最初的变乱之后，会有一段光阴，拷贝数的变动会以高速度累积，终极会下降到根本速度。”

对三阴性乳腺癌会跟着光阴的推移不时倒退的懂得可以解释为什么医治并不老是无效的：一小部门癌细胞能够曾经得到了对特定疗法具备抵制力的渐变。瞻望将来，研讨职员愿望确定肿瘤产生的遗传变动数目是否可预测临床成果。

因为研讨职员证明三阴性乳腺癌细胞系在试验室中培育时也会持续积聚变动，是以这一发现对临床前研讨也具备紧张意义。紧张的是，研讨职员标明，罕用的试验室细胞培育法式无奈疾速天生其基因组，是以无奈发生同质化的肿瘤细胞。

瞻望将来，研讨小组愿望持续研讨其他癌症类型，力求相识这种癌症演化模子是否可以普遍利用于三阴性乳腺癌之外的其它癌症。（100医药网 100yiyao.com）

资讯出处： 原始出处： Nature (2021). dx.doi.org/10.1038/s41586-021-03357-x