寒带莲和温代莲杂交种类F1组织中的方向等位基因表白研讨获停顿

水生动物莲顺应分歧纬度地舆气候而分解为具备分歧性状特征的两个生态类型：公开茎细长不膨年夜的寒带莲和公开茎膨年夜的温带莲。温带莲公开茎膨年夜成藕是其退化进程中紧张的表型立异，膨年夜的公开茎贮存年夜量淀粉等养分物资有助于温带莲顺遂越冬。尽管通过转录组学获得一些参加莲藕膨年夜的症结基因和通路，但基因调控变异的详细作用机制仍不深化，尤其是两类莲的顺式调控变异（如基因启动子区）。等位基因特同性表白（ASE）阐发通常运用于检测物种内的顺反式调控变异。有性生殖的二倍体杂交种中来自双亲的两个等位基因在雷同的细胞情况中裸露于一组独特的反式作用调理因子，正常环境下以为两等位基因的奉献是相等的，现实上在好多杂交F1代中常常发现一些等位基因的表白更方向于某个亲本的征象，等位基因对基因产品的奉献显着偏离1：1，称为等位基因特同性表白（ASE）。F1代中等位基因特同性表白多是亲本之间调控序列区的变异（顺式调控差别）形成的。

为明晰解莲两生态型之间的顺式调控变异若何匆匆进莲的表型分解和顺应性退化，中国迷信院武汉动物园水生动物生物地舆学学科组以温带莲与寒带莲的两个栽培种及其杂交后辈（F1代）为研讨工具（图A），联合重测序和转录组数据，根据已颁发的中国古代莲染色体级其余组装为参考基因组，对F1代分歧时期的花、叶、公开茎组织进行等位基因差别性表白（allele-specific expression，ASE）的阐发。研讨发现，在F1代中来自寒带莲亲本的顺式元件或启动子相较于温带莲更沉闷，等位基因整体上表白方向于寒带莲亲本；与具备表白方向性的等位基因相比，在子一代中表白均衡的基因在其启动子区域分子退化绝对迟缓；顺式调控次要是对公开茎代谢和动物激素相关通路上的症结基因具备显着作用，从而参加了两生态型莲（栽培种类）的顺应性表型分解。(100yiyao.com）