Nature：通过对5万多人分歧的全基因组进行测序来探求人类风险性疾病的成因

2021年4月8日 讯 /100医药网BIOON/ --先进DNA测序技术的开辟及测序本钱的下降让迷信家们能曩昔所未有的规模来深化剖析并研讨人类遗传渐变，为了改善对人类安康的研讨和懂得，这些先进技术就应该被利用到表型优越的人类样本中，并用于树立一定的资本，比方变异目次、节制聚拢和推算参考面板等。日前，一篇颁发在国内杂志Nature上题为“Sequencing of 53，831 diverse genomes from the NHLBI TOPMed Program”的研讨申报中，来自弗吉尼亚年夜学等机构的迷信家们通过对超过5.3万人机体全体遗传构成进行全新的阐发，为相识影响人类心脏、肺脏、血液的功效和就寝阻碍的危险因素提供了新的见解，相关研讨成果也能帮忙研讨职员找到更好的办法来医治并预防惹起机体残疾和灭亡最罕见的起因。

图片起源：https://www.nature.com/articles/s41586-021-03205-y

这项研讨中，研讨职员应用精准医学跨组学（TOPMed，Trans-Omics for Precision Medicine）名目阐发了来自分歧年夜洲的53，831名领有分歧配景的人群机体的完全基因组，此中年夜多半参加者都来自少数群体，而这些群体在遗传学研讨中的代表性素来不敷；所选代表人数的添加象征着迷信家们可能更好地舆解心脏、肺脏、血液和就寝阻碍影响少数群体的机制，并能有助于帮忙削减这些人群恒久存在的安康差距。

研讨者Stephen S. Rich博士说道，人类基因组筹划为迷信家们带来了好多简直来讲基因组学利用于精准医学的研讨中，TOPMed名目便是朝着该偏向迈出的紧张一步，TOPMed的此中一个紧张特色便是其不仅颁布了携带与心脏、肺脏、血液和就寝阻碍相关的年夜量数据的5.3万人的基因组数据，并且还宣布了捐赠血液和数据的参加者的多样性信息。这项创始性的任务中，研讨职员发现了4亿个基因渐变，此中有超过78%的基因渐变此前迷信家们并未描写过，并且近97%的基因渐变极为常见，其产生在不到1%的参加者机体中，该研讨成果既提醒了基因渐变的分子机制，也提醒了基因渐变对人类退化的影响方式。

从未映射读取中发现的保留的非参考祖先序列。

图片起源：Taliun, D., et al. Nature 590, 290–299 (2021).doi：10.1038/s41586-021-03205-y

在所研讨的参加者中，非洲裔人群机体中的基因变异程度最年夜，而本文中所获得的数据是迷信家们有史以来获得的对于非洲裔人群的最好的研讨数据。此外本文研讨成果还为对特定基因渐变的研讨提供了新的思绪，这些基因渐变会下降人类因处方药而获益的才能，这或者是因种族和平易近族而异的。

TOPMed是一项紧张的汗青性尽力结果，其旨在将代表性不敷的少数群体参加者归入到基因组学的研讨中来，TOPMed的全基因组数据能为开辟和检测查询拜访人类渐变的办法、腿短人类生齿统计学和摸索基因组的功效约束提供了十分名贵的资本，除了这些用途外，研讨者还推测，TOPMed数据将来将可能改善简直一切正在进行的罕见和常见的疾病，其会提供对于安康个别的深化渐变目次和响应资本，从而就能匆匆进基于阵列的研讨来完成此前只能通过间接测序来完成的数据实现性。

TOPMed研讨中祖先、遗传多样性和常见渐变之间的遗传联系关系性。

图片起源：Taliun, D., et al. Nature 590, 290–299 (2021).doi：10.1038/s41586-021-03205-y

综上，TOPMed研讨中普遍的遗传变异目次为摸索常见和非编码序列渐变对表型渐变的奉献提供了十分紧张的研讨线索和机遇，此外，将TOPMed与当代伎俩相联合还可能改善全基因组联系关系性研讨的才能和范畴，其或会将渐变的产生率下降到年夜约0.01%。（100医药网100yiyao.com）

原始出处：

Taliun, D., Harris, D.N., Kessler, M.D. et al. . Nature 590, 290–299 (2021).doi：10.1038/s41586-021-03205-y