研讨提醒陆地无脊椎植物RNA病毒的遗传多样性 |
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《中国迷信:性命迷信》(SCIENCE CHINA Life Sciences)在线颁发了中国迷信院上海巴斯德研讨所研讨员崔杰课题组题为Virome in Marine Ecosystems Reveal Remarkable Invertebrate RNA virus Diversity的研讨结果。
陆地蕴藏着丰厚的资本,具备开辟后劲;陆地生物平安成绩异样必要惹起足够的看重。陆地中不仅存在尚未被发现的动、动物物种,还存在数目更庞年夜、品种单一的微生物。传统的陆地病毒研讨多集中在以噬菌体为代表的DNA病毒上,对多样性高、基因组不稳定的RNA病毒的多样性、散布特征及传达形式等均不分明。
该研讨中,研讨职员从分歧海疆共采集到3门6纲58种的陆地无脊椎植物样品,并应用宏转录组的测序办法对分歧物种的RNA病毒组进行研讨。研讨职员使用改良的生物信息阐发办法,鉴定出涵盖9个病毒家族(Durnavirales、Totiviridae、Bunyavirales、Chuviridae、Picornavirales、Flaviviridae、Hepelivirales、Solemoviridae、Tombusviridae)的363个RNA病毒,此中的315个与已知的RNA病毒类似度较低,被以为是全新的RNA病毒。该研讨初次报道了陆地汉坦样病毒,其较海洋汉坦病毒更陈旧,是以,提出了汉坦病毒能够具备陆地来源的假说。联合基因组构造和统计学阐发,研讨职员展现了丰厚的陆地病毒多样性和病毒基因组可塑性,提醒了分歧海疆间、分歧宿主种别间能够存在的病毒传达征象。整体而言,该研讨通过解析陆地无脊椎植物RNA病毒组,刻画病毒生态圈,为陆地RNA病毒的来源、退化、传达提供了紧张见解。(100yiyao.com)
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