韩国首尔根底迷信研讨所：SARS

2021年5月18日讯/BIOON/---韩国首尔根底迷信研讨所RNA研讨中间的研讨者在Molecular Cell杂志上颁发了题为"大众The SARS-CoV-2 RNA interactome公众的文章。该研讨鉴定了与冠状病毒rna间接互相作用的病毒和宿主卵白。通过SARS-CoV-2与HCoV-OC43的比拟显示冠状病毒RNA互相作用组的激进性。作者还提醒了17种抗病毒因子，如LARP1、ZC3HAV1、TRIM25、PARP12和SHFL。末了作者还发现了9个被SARS-CoV-2挟制的前病毒因子，包含EIF3D和CSDE1。

图片起源：Lee et al.， 2021， Molecular Cell 81， 1-13 https：//doi.org/10.1016/j.molcel.2021.04.022

冠状病毒(coronavirus，CoV)是一组囊膜病毒，属于冠状病毒目冠状病毒科冠状病毒科冠状病毒亚科Nidovirales、冠状病毒科CoV和冠状病毒亚科Nidovirales、冠状病毒科CoV、冠状病毒亚科CoV。它们分为四个属：专门感化哺乳植物的阿尔法冠状病毒和β冠状病毒，以及次要感化鸟类的伽马冠状病毒和德尔塔冠状病毒。人类冠状病毒，如Alphacoronavirus HCoV229E和Betacoronavirus HCoV-OC43，自20世纪60年月以来始终被以为是一般伤风的病原体。比来，环球呈现了三种高致病性人类冠状病毒：2002年的重大急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、2012年的中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)和2019年的SARS-CoV-2。比来的一种是SARS-CoV-2，它会招致被称为2019年冠状病毒病(新冠肺炎)的呼吸道疾病。2020年3月，疫情被天下卫生组织(WHO)发布为年夜风行。

在冠状病毒颗粒的焦点，RNA基因组被包裹在核衣壳(N)卵白中，并被包括刺突(S)卵白、膜(M)卵白和包膜(E)卵白的病毒膜所包抄。冠状病毒rna基因组全长30kb，是rna病毒中最长的，包括一个50帽构造和一个30聚(A)尾巴。在进入细胞后，基因组rna(Grna)作为一种信使核糖核酸(Rna)发生病毒rna所需的非构造卵白(Nsps)。ORF1a编码多肽1a(pp1a；440-500 kDa)，被切割成11个NSP。核糖体1移码产生在ORF1a终止暗码子的下游，许可上游ORF1b的翻译，发生一个年夜的多肽(pp1ab；740-810 kDa)，被切割成15个NSP。统共发生了16个分歧的NSP片断，以许可病毒RNA合成的后续步调。

在病毒翻译的最初阶段之后，gRNA被用作合成负链(-)的模板。RNA，它们反过去充任正向(+)RNA合成的模板。从SARS-CoV-2基因组中发生了10种分歧的(+)RNA，此中包含1个全长gRNA和9个亚基因组RNA(SgRNAs)。一切典型的病毒(+)RNA共享独特的50端序列，称为前导序列和3"大众端序列。SgRNAs是通过不间断转录发生的，这招致了50前导序列与含有上游开放浏览框架(编码构造卵白(S、E、M和N)和辅助卵白(3a、3c、6、7a、7b、8和9b)的"大众"大众身材公众"大众部门之间的交融)。

在这项研讨中，作者开辟了一个弱小的RNP捕捉协定来界说与冠状病毒(SARS-CoV-2和HCoV-OC43)转录原形关的病毒和宿主卵白库。网络和转录组阐发联合击倒试验提醒了将病毒RNA与mRNA调理因子和假定的抗病毒因子分割在一路的宿主因素。

全面鉴定间接与SARS-CoV-2 RNA互相作用的宿主和病毒卵白图片起源：Lee et al.， 2021， Molecular Cell 81， 1-13 https：//doi.org/10.1016/j.molcel.2021.04.022

SARS-CoV-2是一种RNA病毒，其作为病原体的胜利依赖于其改动宿主RNA联合卵白(RBPs)的用途和回避抗病毒RBPs的才能。为了提醒SARS-CoV-2RNA互相作用组，作者开辟了一种强健的核糖核卵白(RNP)捕捉协定，并鉴定了109个间接与SARS-CoV-2RNA联合的宿主因子。将RNP捕捉到另一种冠状病毒HCoV-OC43上，提醒了冠状病毒RNA和宿主卵白之间退化上激进的互相作用。转录组阐发和敲除试验描写了17个抗病毒限定性贸易常规，包含ZC3HAV1，TRIM25，PARP12和SHFL，以及8个前病毒限定性贸易常规，如EIF3D和CSDE1，它们担任选择mRNA性命周期的多个步调。这也招致了mTOR旌旗灯号通路的上游靶点LARP1被确定为与SARS-CoV-2RNA互相作用的抗病毒宿主因子。总体而言，这项研讨提供了调理冠状病毒复制的限定性贸易常规的综合清单，并为医治干涉开发了新的路径。(100医药网 100yiyao.com)