Cell：提醒一种常见的曩昔未知的巨噬细胞与医治后的肾癌复发无关

2021年5月27日讯/BIOON/---与其他癌症相比，肾癌的免疫个性十分突出：与年夜多半其他实体瘤相比，有更多的免疫细胞浸润肾癌，并且肾癌是对当今免疫医治方案反馈最强烈的恶性之一。然而，虽然进行了医治，许多肾通明细胞癌（clear cell renal carcinoma，最罕见的肾癌类型）患者终极照样会复发，并呈现无奈治愈的转移性疾病。

在一项新的研讨中，美国研讨职员发现肾脏中存在一种常见的、曩昔未知的免疫细胞类型，可以预测哪些患者在手术后能够会呈现癌症复发。这些细胞乃至能够驱动侵袭性疾病。这些成果标明这些细胞的存在能够用来辨认手术后疾病复发的高危险患者，这些患者能够是更踊跃的医治的候选工具。

相关研讨成果于2021年5月20日在线颁发在Cell期刊上，论文题目为“Single-cell protein activity analysis identifies recurrence-associated renal tumor macrophages”。

尽管肾脏被免疫细胞密集浸润，但免疫细胞亚型及其与术后预后的关系在很年夜水平上仍是未知数。为了提醒浸润肾癌的免疫细胞的精密细节，这些作者联合了癌症研讨中的两种最新技术。

第一种技术，称为单细胞RNA测序，捕捉了内单个细胞的基因活性快照。这种使得人们可能在一次试验中从一种的数万个细胞中得到这种快照，从而深化相识各类细胞类型的身份和行动。

这种弱小的技术可以辨认新的细胞类型，但也有一个缺陷。由于单细胞测序是通过检测每个细胞内的少量mRNA分子来任务的，它往往不克不及检测到表白程度低的基因的mRNA，包含症结旌旗灯号基因和药物靶点，如免疫疗法查看点。在许多试验中，单细胞RNA测序会脱漏高达90%的基因活性，这种征象被称为基因丢弃（gene dropout）。

这些作者通过开辟一种预测算法来解决基因丢弃成绩，该算法可以通过检查其他相关基因的表白来揣摸哪些基因是沉闷的。即便因为基因丢弃招致好多数据丧失，他们仍旧有足够的线索来揣摸下游调理基因的活性。

该算法被称为meta-VIPER，树立在哥伦比亚年夜学瓦格洛斯表里迷信院的Andrea Califano试验室开辟的VIPER算法的根底上。跟着metaVIPER的退出，这些作者估量他们可以精确地检测出每个细胞中70%至80%的调理基因的活性，打消了细胞中的基因丢弃征象。

图片来自Cell, 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.04.038。

该结合办法用于阐发从在哥伦比亚年夜学泌尿内科承受手术的11名通明细胞肾癌患者体内获取的20多万个细胞和附近组织中的正常细胞。

该阐发提醒了一种共同的巨噬细胞亚群，它们只在中发现，并与初始医治后疾病的终极复发无关。meta-VIPER阐发还提醒了节制这些巨噬细胞活性的主调理基因。这一“特征”在与范德比尔特年夜学的研讨职员单干得到的第二组患者数据中获得了验证；这一特征强烈地预测了第二组150多名患者的复发。

此外，这些巨噬细胞被发现通过成对的受体-配体基因与细胞间接互相作用。这些数据提出了一种回味无穷的能够性，即这些巨噬细胞不仅仅是更风险的疾病的标记，并且理论上能够招致疾病的复发和停顿，并且靶向这些巨噬细胞可以改善临床成果。是以，基于VIPER的技术，如Oncotreat测试，能够用于确定靶向这些常见但症结的巨噬细胞亚群的药物，从而避免与它们的存在相关的不良成果。

这些作者表现，单细胞测序与meta-VIPER算法的联合也有后劲阐发其他类型的癌症。这项新的研讨标明，这两种技术联合在一路时，对描写内和四周组织中的细胞十分无效，应该具备普遍的实用性，而不仅仅限于癌症研讨。（100医药网 100yiyao.com）

参考材料：

Aleksandar Obradovic et al. . Cell, 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.04.038.