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对于相拆散通过调控染色质三维构造重组匆匆进细胞命运行变的研讨在Cell Stem Cell颁发

真核细胞染色体通常会有序的折叠,在空间上会造成有序的三维构造。这些三维构造由年夜到小次要分为区室分隔(compartments)、拓扑相关构造域(Topological-Associated Domains,TADs)以及染色质环状构造(loops)等。细胞命运行变进程中往往随同着染色体三维构造的激烈变动,而这些变动关于推进细胞命运行变的进行起到紧张作用。TAD通常被以为是一种绝对激进的构造,在分歧物种和统一物种的分歧细胞之间趋于稳定。然而近年来的研讨发现,在细胞分解的进程中,TAD的数目和年夜小都邑产生变动,这阐明TAD在细胞命运行变进程中有能够产生了重组。是以,探讨TAD重组因素及其和细胞命运行换之间的关系尤为紧张。

中山医学院丁俊军试验室在Cell Stem Cell上颁发了题为“Phase separation of OCT4 controls TAD reorganization to promote cell fate transitions” 的文章,初次说明了症结转录因子OCT4通过相拆散(phase separation)机制调控TAD重组以推进体细胞重编程的进行。该研讨是第一篇论述相拆散机制调控染色质高级构造以推进细胞命运行变的文章。

在该项研讨中,研讨职员起首对体细胞重编程分歧时期进行了三维、、转录组学和表观组学等多组学的四维整合性阐发,通过这些阐发获得了重编程进程中以TAD重组为焦点的染色体三维构造的变动特色;论述了OCT4介导的染色体环状构造的动静变动通过改动TAD界限上CTCF的联合以调控TAD重组的新机制;进一步发现OCT4的相拆散个性可调控TAD重组和细胞命运行变;进而发现,通过操控TAD重组和OCT4的相拆散,可以调控细胞命运行变;终极通过基于TAD重组的新算法鉴定出了新型细胞命运调控因子,并对这些新型细胞命运调控因子做了功效验证。

该论文初次发现卵白质相拆散、染色质三维构造和细胞命运行变之间的调控机制,树立了通过操控TAD重组、和节制卵白质相拆散,从而调控细胞命运的新办法,也开辟了基于染色质三维构造精准预测细胞命运调控因子的新算法。(100yiyao.com)

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