全文!新冠环球溯源研讨中国部门颁布!

许多晚期病例与华南海鲜市场无关，但也有类似数目的病例与其他市场无关，有些病例与任何市场均有关。12月在更普遍社区内的传达可以解释与华南海鲜市场有关的病例，另外存在与该市场有关的晚期病例，这可以标明华南海鲜市场不是疫情的发祥地。然而，其他尚未确认的较轻的病例能够提供华南海鲜市场与晚期病例之间的分割，而这些晚期病例之前以为与市场没有显明的分割。是以，对于华南海鲜市场在疫情来源中的作用或许感化是若何传入市场的，今朝尚无奈得出确实论断。

鉴于2021年1月和2月拜访武汉时代的光阴无限，应答174例确诊病例进前进一步结合回想，包含阐发病例的临床和生齿特征以及风险因素。是否从新对这些患者进行当面扣问取决于结合回想的成果。结合小组还建议回想2019年12月申报为COVID-19潜在病例的其他患者的信息，以相识这些病例是否属于先前未被确认的COVID-19病例，以及是否对SARS–CoV-2在初次确认疫情时代在本地人群的感化环境提供任何额定的信息

分子风行病学

由于年夜多半新型病毒都起源于植物，以是要相识招致病毒溢出和环球传达的进程就必要深化相识植物贮主所携带病毒的多样性和演化，植物、情况和人类之间的互相作用，以及造成无效人传人的因素。能招致环球年夜风行的病毒肯定高度顺应了人类情况。这种顺应能够是突然得到的，也能够是颠末多个步调逐步得到的，并且每个步调都是自然选择所推进的。

是以，SARS-CoV-2的溯源任务应将重点放在两个阶段。

第一阶段波及病毒在产生人畜共患转移前在植物宿主（如蝙蝠、穿山甲或其他家养或六畜）中的轮回。在这一退化进程中，各类植物物种都能够成为贮主。SARS-CoV-2的祖先株能够在其轮回进程中得到了感化人类的才能。与SARS-CoV-2病毒高度同源序列病毒的发现标明SARS-CoV-2能够源于人畜共患的传达，但其贮主仍有待查明。

第二阶段波及产生人畜共患转移后SARS-CoV-2在人群传达进程中的演化。这种植物到人的溢出的能够性跟着植物和人打仗的频率以及强度添加而添加。溢出能够会重复产生，但要是贮主中的病毒基因组必要进一步顺应以完成无效的继续传达，那这种晚期的溢出能够不会被发现。一旦具备年夜风行后劲的病毒产生演变或溢出，那么它们就会得到扩散的才能，招致年夜量具备顺应性渐变的病毒株在分歧地区的人群中呈现，从而引发COVID-19年夜风行。

植物的基因组数据

迄今为止的查询拜访和针对性研讨的证据标明，在蝙蝠和穿山甲中发现了与SARS-CoV-2关系最亲密的冠状病毒。样本病毒与SARS-CoV-2的基因序列具备高度类似性，提示上述哺乳植物能够是招致COVID-19的病毒的贮主。

然而，到今朝为止，从99个物种中发现的病毒与SARS-CoV-2的类似度都不敷以使其成为SARS-CoV-2的间接祖先。除了这些发现，水貂和猫对SARS-CoV-2的高度易理性标明，能够还有其他植物物种（鼬科或猫科植物，以及其他物种）是潜在的贮主。将序列数据库中的数据与潜在贮主物种查询拜访中的数据进行比拟后发现，这些能够的贮主物种的标本采集重大不敷。

对病毒基因组和年夜风行晚期风行病学数据的阐发

结合团队回想了通过中国国度生物信息中间在其包括一切可用冠状病毒序列和元数据的综合数据库中搜集的数据。选择了2019年12月和2020年1月搜集的样本的一切序列数据进行深化阐发，回想了病毒在年夜风行第一阶段的多样性。关于在中国武汉发现的病例，将其数据与风行病学配景相分割后选择12月31日前发病的病例。

终极阐发成果显示，在裸露于华南海鲜市场的病例中，有几例病例的病毒基因组是雷同的，阐明这些病例能够是某个凑集病例群的一部门。但序列数据也显示，武汉市年夜风行初期就曾经存在一定的病毒多样性，阐明在华南海鲜市场群之外还有未采样的传达链。从生肉裸露或毛皮植物裸露的风行病学参数来看，没有显明的病例凑集征象。

依据晚期序列数据估量到比来独特祖先的光阴

此外，通过火析来估量终末数据集中SARS-CoV-2序列到比来的独特祖先的光阴（tMRCA），并与之前的研讨成果进行比拟。如许的tMRCA阐发可以被以为是估量的，并不克不及提供来源光阴切实其实切证实。分子序列数据阐发标明年夜风行的开端光阴能够在12月中旬之前的某个月。估量的光阴点从9月下旬到12月上旬不等，但年夜多半估量点在11月中旬到12月上旬之间。

SAES-CoV-2的文献综述：晚期发现

末了，对已颁发的文献中标明SARS-CoV-2晚期轮回的数据进行了回想。这些来自分歧国度的研讨标明，SARS-CoV-2的轮回比最初发现病例的光阴早了几周。部门疑似阳性样本的检测光阴乃至早于武汉首例病例，提示其他地域能够存在漏诊的环境。但到今朝为止，研讨的质量还很无限。虽然如斯，查询拜访这些潜在的晚期变乱照样很紧张的。

植物及情况研讨人们在分歧植物中发现了在体系退化上与SARS-CoV-2相关的冠状病毒，包含菊头蝠和穿山甲。然而，在湖北省采用的蝙蝠样本并未发现SARS-CoV-2病毒存在的证据，中国各地家养植物的采样至今也未发现SARS-CoV-2的存在。我国31个省共采集家养植物、畜禽标本8万余份，在SARS-CoV-2暴发前后均未发现SARS-CoV-2抗体和核酸阳性成果。通过对华南海鲜市场植物产物的普遍检测，未发现植物感化的证据。