全基因组分析如何帮助人类疾病研究？

来源：100医疗网原创2022-05-06 15336044

在这篇文章中，边肖整理了多项重要的研究成果，并共同阐述了科学家如何进行全基因组分析来帮助人类疾病的研究，并与大家分享！

在这篇文章中，边肖整理了一些重要的研究成果，并与您分享普通科学家如何进行全基因组分析，以帮助人类疾病的研究！

人类癌症预后特征的全基因组鉴定和分析

图片来自：https://doi.org/10.1016/j.celrep.2022.110569

【1】

doi:10.1016

准确区分侵袭性癌症和惰性癌症的能力是预测患者风险的基础，并可以指导关键的治疗决策。对于良性癌症，仔细等待和/或手术切除可能是合适的，而浸润性癌症可能需要采用细胞毒性疗法的多模式治疗，这本身将导致相当高的发病率。癌症的治疗不足和过度治疗已被确定为患者死亡的重要原因，这突出表明迫切需要提高我们准确识别最具侵袭性的恶性肿瘤患者的能力。目前，风险预测在很大程度上取决于对疾病状态的组织病理学和放射学评估。淋巴结转移和细胞去分化的存在被认为是患者预后的有力预测因子，并用于确定癌症的阶段和等级。然而，这些病理标记需要主观判断，观察者之间的符合率较低。此外，即使是一个完美的肿瘤分期也不能清楚地预测一个患者随后的临床病程。

最近，耶鲁大学医学院的研究人员在《细胞报告》杂志上发表了一篇题为《人类癌症预后特征的全基因组识别和分析》的文章。该研究和分析为预后生物标志物的分析建立了丰富的资源，并阐明了患者存活数据在临床前癌症研究和治疗开发中的应用。癌症的临床决策取决于对患者风险的准确评估。为了提高我们识别最具侵袭性的恶性肿瘤的能力，研究人员利用10，884名患者的基因表达、拷贝数、甲基化和突变数据构建了一个全基因组生存模型。

研究人员已经确定了超过10万个重要的预后生物标志物，并证明这些基因组特征可以预测患者的预后，即使临床上不清楚。尽管不利的生物标志物通常被认为代表癌症驱动因素和有希望的治疗靶点，但研究人员已经表明，与较短生存期相关的癌症特征不会对癌基因或成功的药物靶点产生丰富的影响。相反，最强的坏生物标记代表广泛表达的细胞周期和基因，因此，几乎所有针对这些特征的治疗在临床试验中都失败了。

【2】

doi:10.1126/科学. abl9283

突变信号(也被翻译为突变信号、突变标记或突变信号)——在肿瘤发生中起作用的DNA损伤和修复过程的标记——使人们了解每个患者癌症的环境和内源性原因。基因组测序研究允许探索突变特征。在一项新的研究中，来自英国剑桥大学的研究人员对各种肿瘤类型的大量癌症进行了全基因组测序，比以往的研究多得多，以全面加强他们对突变特征的理解。相关研究成果发表在2022年4月22日的《科学》杂志上，题目是《英国人群全基因组测序癌症中的替代突变签名》。

这些作者分析了国民医疗服务体系(NHS)为100，000基因组计划前瞻性收集的12，222种癌症的突变特征。他们独立鉴定了每个器官中单碱基置换(SBS)和双碱基置换(DBS)的突变特征。利用这个特别大的队列，他们开发了一种方法，以加强常见突变过程和罕见的低频突变过程之间的区别。

这些作者通过独立分析两个开放队列的数据验证了他们的发现——国际癌症基因组联盟(ICGC)的3001例原发性癌症和Hartwig医学基金会的3417例转移性癌症。通过比较和对比独立获得的组织特异性突变特征，并进行聚类分析，他们将可能由相似过程引起的不同组织的突变特征结合起来，从而产生一组参考突变特征。

【3】

doi:10.1038/s41467-021-27616-7

细菌基因组测序的最新进展使研究人员能够成功绘制结核分枝杆菌抗生素耐药性基因组特征的完整目录。最近，国际杂志《自然通讯》发表了一篇题为《基因组签名》的文章