自然:大进步！发展实况

来源：100医疗网原创2022-08-23 10336019

在一项新的研究中，瑞士洛桑联邦理工学院的Bart Deplancke教授和他的研究团队以及苏黎世联邦理工学院的Julia Vorholt教授和他的研究团队解决了一个scRNA-seq的问题：它需要被切割。

RNA测序使科学家能够研究细胞中的基因表达。由于信使RNA(mRNA)是由DNA基因转录产生的，这些信息可以用来识别原始的基因序列，从而测量这些细胞中成千上万个基因的活性，即转录组。

RNA测序的挑战是如何从混合群体中捕获特定细胞的mRNA这是自然界中大多数细胞的存在方式。因此，科学家们开发了单细胞RNA测序(scRNA-seq)，为基础和生物医学研究甚至药物开发提供了前所未有的新见解。

介绍实时序列

现在，在一项新的研究中，瑞士洛桑联邦理工学院的Bart Deplancke教授和他的研究团队以及苏黎世联邦理工学院的Julia Vorholt教授和他的研究团队解决了一个scRNA-seq的问题：需要溶解(杀死)细胞。他们提出了直播序列。这种创新的方法可以在提取RNA时保持细胞的活力以供进一步研究，同时也是微创的。相关研究成果于2022年8月17日在线发表在《自然》杂志上，论文标题为Live-Seq使单细胞的临时转录组学记录成为可能。

Live-seq的关键是一项名为fluid force microscopy(fluid FM)的显微技术，它使用比人头发还细的显微通道，在几年前由苏黎世联邦理工学院开发的显微镜下操纵样品中微小体积的液体(飙升)。正因为如此，FluidFM允许用户将物质插入到单个细胞中，或者从单个细胞中提取包括mRNA在内的细胞质，而不必杀死它们。

当这些作者设法从这些极小的细胞质样品中保存和读取mRNA(转录组)时，导致Live-seq的关键进展出现了。因此，Live-seq现在可以将细胞在特定时间的转录组与其后期的分子或表型行为联系起来，即在离散的时间点上监测细胞中数千个基因的活动——科学家称之为时间转录组分析。

Deplancke说，有了Live-seq，我们现在可以独特地解决非常有趣的生物医学相关问题，例如为什么一些细胞会分化，但姐妹细胞不会，或者为什么一些细胞对一种癌症药物有抗性，但它们的姐妹细胞不会。

Live-seq几乎不会引起表达式变化。图片来自Nature，2022，doi :10.1038/s 41586-022-05046-9。

当测试Live-seq时，这些作者发现它可以准确地识别(分类)不同的细胞类型和状态，而不会引入显著的干扰。作为概念的证明，他们使用他们的新平台直接绘制了单个细胞(巨噬细胞)在变得活跃之前和之后的轨迹，以及脂肪基质在分化为脂肪细胞之前和之后的轨迹。最后，他们使用Live-seq作为转录组记录器，这使他们能够预测免疫细胞对免疫挑战的反应强弱。

Vorholt表示，Live-seq通过将scRNA-seq从终点转化为时空分析方法，可以解决广泛的生物学问题。(100yiyao.com)

参考资料：

陈万泽等。自然，2022，doi :10.1038/s 41586-022-05046-9。

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