科学进展:发现癌症中一种新的长度依赖性异常剪接调控模式 |
![]() |
中国科学院上海营养与健康研究所的王泽峰研究团队在科学进展发表了题为《癌症中广泛存在的长度依赖性剪接调控》的研究论文。这项研究在癌症中发现了一种新的长度依赖的选择性剪接调控模式。人类基因组中90%以上的基因需要进行选择性剪接,剪接的错误调控会导致许多人类疾病,尤其是癌症。越来越多的证据表明,RNA剪接异常与人类癌症密切相关,广泛剪接异常是癌症的分子标记之一。因此,系统地探索可变剪接在癌症中的异常调控,将为癌症治疗提供新的思路。
本研究分析了TCGA数据库中的大规模癌症转录组数据,识别了癌症中存在异常剪接的外显子,发现癌症中存在异常剪接的外显子长度趋于变短,而这些短外显子在癌症中趋于被跳过。在这项研究中,确定了494个癌症相关的短外显子(病例),并进行了进一步的研究。研究人员通过使用CASE的拼接开发了一种用于癌症预测的随机森林模型,该模型可以准确预测癌症样本,AUC约为0.9。此外,本研究还提出了通过病例拼接计算危险因子来预测癌症患者预后的方法,该方法在TCGA数据集和其他独立的癌症数据集上均有较好的预测效果。
在机制研究中,本研究提出了影响案例拼接的两种机制。癌细胞的快速生长和增殖需要更快的转录过程,因此癌症中的异常转录可能会影响剪接。对不同转录延伸速度的细胞系中选择性剪接的分析表明,短外显子对转录速度的变化更敏感,更容易受到转录速度变化的干扰,导致外显子跳跃。转录对剪接的影响是广泛的和非选择性的。这项研究进一步表明,癌症中特定短外显子的跳跃是由剪接因子调控的。通过分析ENCODE数据库中大量RNA结合蛋白(RBPs)的相关组学数据,建立了RBPs对案例剪接的直接调控网络,并鉴定了几个调控案例剪接的RBPs,包括RBFOX2、AQR、U2AF2、PTBP1等。
医药网新闻
- 相关报道
-
- 《自然·医学》:世卫组织最新预警!全球08-17年出生的人,或有1560万会患胃癌,76%归因与幽门螺杆菌感染,2/3发生在亚洲 (2025-07-09)
- 精鼎医药宣布两位 FDA 权威专家加入我司咨询团队,进一步增强监管事务、医学及 AI 领域专业实力 (2025-07-08)
- Mater Today Bio:干细胞球联手纳米颗粒水凝胶精准改善糖尿病创面环境,加速伤口愈合新突破 (2025-07-08)
- J Anim Sci Biotechnol研究揭秘美味密码:益生菌联手重塑肠道菌群,经肠-肌轴提升猪肉鲜味与品质 (2025-07-08)
- Science:告别序列依赖,为你的染色体“扫码”——每条染色体竟自带独一无二的“条形码 (2025-07-07)
- 《自然》子刊:刷新认知!哈佛团队发现,乙肝病毒自身或不致肝癌,但会增强致癌物的作用 (2025-07-07)
- 《科学》子刊:科学家揭示帕金森病中不同的发病轨迹,或为定义亚型和治疗靶点提供新见解! (2025-07-07)
- 《细胞》破解常见痴呆的治疗难题!“老药新用”有望恢复大脑功能 (2025-07-07)
- 华人学者本周发表4篇Cell论文:高度血管化的肺/肠道类器官;修复血管性痴呆;自身免疫病新疗法;同义突变调控性状 (2025-07-07)
- 内蒙古安迪科同位素诊疗药物生产中心举行奠基仪式 (2025-07-06)
- 视频新闻
-
- 图片新闻
-
医药网免责声明:
- 本公司对医药网上刊登之所有信息不声明或保证其内容之正确性或可靠性;您于此接受并承认信赖任何信息所生之风险应自行承担。本公司,有权但无此义务,改善或更正所刊登信息任何部分之错误或疏失。
- 凡本网注明"来源:XXX(非医药网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。本网转载其他媒体之稿件,意在为公众提供免费服务。如稿件版权单位或个人不想在本网发布,可与本网联系,本网视情况可立即将其撤除。联系QQ:896150040