BMC Biology:研讨提醒棉花着丝粒退化与抗逆性状分解机制 |
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近日,中国农业迷信院棉花研讨所棉花分子遗传改进立异团队展开了棉花着丝粒的退化研讨,开辟出鉴定着丝粒的新办法,说明了棉花着丝粒的疾速退化机制,提醒了姊妹种抗逆性状分解的分子机制。该研讨为动物的着丝粒退化研讨提供了参考,为棉花的退化和抗逆改进提供了资本。相关研讨结果颁发在《BMC生物学(BMC Biology)》上。
据团队首席李付广研讨员引见,着丝粒是连贯一对姐妹染色单体的特化DNA序列,它可能保障染色体在决裂的细胞中准确通报。着丝粒由高度简单的反复序列组成,在基于短读长组装的基因组中序列质量不高,重大限定了人们对着丝粒功效和退化的意识。该研讨基于孔的单分子及时电旌旗灯号测序技术(ONT)长读长序列,组装得到了瑟伯氏棉和戴维逊棉高质量的参考基因组序列。应用Hi-C热图开辟出鉴定着丝粒的新办法,胜利鉴定棉花的着丝粒序列。通过共线性阐发发现,着丝粒附近区在分歧棉种的同源染色体间坚持优越的线性关系,而着丝粒区未见显明的共线性,阐明着丝粒退化速率更快。进一步研讨阐发发现,种间同源染色体的着丝粒序列高度分解,所包括的转座子活性显着高于非着丝粒区的,说明了着丝粒的疾速退化机制。此外,研讨还提醒了棉属姊妹种间的抗逆型分解的潜在分子机制,发现水杨酸旌旗灯号通路在瑟伯氏棉与雷蒙德氏棉抗病分解中具备紧张作用。脱落酸旌旗灯号通路、乙烯合成通路基因的差别表白能够招致了戴维逊棉与雷蒙德氏棉的耐盐才能分解。(100yiyao.com)
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