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来源:华大知止2021-12-01 17:11
近日,南非新发现的超级新冠肺炎突变株Omicron(B.1.1.529)在全球范围内迅速传播,给疫情防控监测体系带来了巨大挑战。
近日,南非新发现的超级新冠肺炎突变株Omicron(B.1.1.529)在全球范围内迅速传播,给疫情防控监测体系带来了巨大挑战。11月29日16时,瑞典斯卡纳报告1例新冠肺炎确诊病例为奥米克隆突变株。这种变异菌株是在一周多前从一名居住在斯卡纳的人身上采集的样本中检测到的,该人一周前刚从南非返回。
在此背景下,瑞典公共卫生部门合作的卡罗林斯卡医学院国家疫情中心利用华大智能ATOPlex数据库构建套件和MGISP高通量自动化数据库构建平台,第一时间发现了Omicron突变株,100X基因组覆盖率超过98%。
Ato平台帮助瑞典第一时间发现Omicron突变株
众所周知,在南非发现的新冠肺炎突变株Omicron(B.1.1.529)含有大量突变,这很可能是更具传染性和免疫逃逸。世卫组织建议各国采取多项行动,包括加强病例监测和测序,并在公开可用的数据库(如GISAID)中共享基因组序列,以更好地了解奥米克龙是否具有不同的传播或疾病特征,或者它是否影响疫苗、治疗或公共卫生和社会措施的有效性。
针对新发现的突变株,华大知止创建了以超高分子量PCR技术为核心的ATOPlex平台开发的数据库构建试剂盒,帮助瑞典第一时间发现Omicron突变株。同时,还可以获得该菌株的全基因组序列,为新菌株监测提供了有力的工具支持。
瑞典新增1例新冠肺炎确诊病例为Omicron突变株(来源:“最瑞典”微信微信官方账号)
ATOPlex平台为全球突变株监测提供工具支持。
根据数据分析结果,证实了ATOPlex平台开发的数据库试剂盒(高通量测序法V1.1/V2.0/V3.0)可以有效监测Omicron突变株的变异和溯源。华志昭一直在分析新的变异毒株,持续评估变异毒株的能力,确保ATOPlex试剂盒的性能,助力全球疫情监测!
此外,ATOPlex平台还覆盖了DNA、RNA和DNA甲基化方向,可满足科研、医药、食品安全、农业、DTC等相关领域个性化基因检测产品的定制需求。在微生物研究领域,ATOPlex技术不仅可以对Omicron等新菌株进行有效的分类和监测,还可以为其他威胁人类健康的病原微生物提供个性化的监测方案,从而满足公共卫生领域不同微生物的检测和监测需求。(100医学网络生物)
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