中山大学生命科学学院RNA组学团队开发了Polⅲⅲ转录的非编码RNA功能网络信息库

来源：中山大学2022-01-02 19:53

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授开发了Pol3Base数据信息库，系统鉴定了RNA聚合酶III(Pol)转录的非编码RNA(P3RNA)，全面分析了P3RNA的相互作用群、表达、进化、表观基因组、疾病变异和调控网络。Pol3Base网站整合了由不同转录因子调控的数千个RNA聚合酶III转录的ncRNAs转录组数据。Pol3Base

中山大学生命科学学院RNA组学团队杨建华教授开发了Pol3Base数据信息库，系统鉴定了由RNA聚合酶III(PolIII)转录的P3RNA，全面分析了P3RNA的相互作用群、表达、进化、表观基因组、疾病变异和调控网络。

Pol3Base网站整合了由不同转录因子调控的数千个RNA聚合酶III转录的ncRNAs转录组数据。Pol3Base的所有结果都存储在MySQL数据库中，并通过网页显示。

RNA组学团队率先开发了一系列分析流程，发现了~ 79，000个Pol转录(p3RNA)与转录因子的相互作用组，以及这些p3RNA与240多种RNA结合蛋白的相互作用网络；揭示了70例正常组织和28种不同肿瘤类型中P3RNA和9700个表观RNA修饰位点的表达谱。此外，通过比较人和小鼠，约有4000个进化上保守的P3RNA被发现了。在32个不同的组织中鉴定出数万个tsRNA。通过分析体细胞突变数据，Pol3Base还提供了这些ncRNA的突变图谱，以帮助揭示它们在许多疾病中的潜在作用。

这项研究最近在线发表在《核酸研究》杂志上。杨建华教授、曲良辉教授、李斌副教授和郑玲玲副教授是该论文的共同作者。蔡莉博士和宣佳佳博士为共同第一作者。(100yiyao.com)

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