该研究揭示了叶绿体基因组树对优化我国大型林分群落建设的认知 |
![]() |
来源:华南植物园2022-01-06 22:03
认知生物多样性的形成和维持机制,即群落建设,是生态学研究的核心问题。系统发育群落生态学将系统发育分析的方法融入到群落生态学的分析中,为探索群落生物多样性的演化和维持机制提供了新的视角。建立准确可靠的群落系统发育树是进行群落系统发育分析的前提和基础。低分辨率的群落系统发育树可能导致系统发育多样性指数估计的偏差,进而影响特定群落生态过程的推断。目前,社区系统树的构建者
认知生物多样性的形成和维持机制,即群落建设,是生态学研究的核心问题。系统发育群落生态学将系统发育分析的方法融入到群落生态学的分析中,为探索群落生物多样性的演化和维持机制提供了新的视角。建立准确可靠的群落系统发育树是进行群落系统发育分析的前提和基础。低分辨率的群落系统发育树可能导致系统发育多样性指数估计的偏差,进而影响特定群落生态过程的推断。目前,群落系统进化树的构建主要使用了Phylomatic、V . PhyloMaker等。生成目录合成树,或者基于第一代DNA条形码片段构建分子系统发育树。树合成法不需要采样、测序等步骤,成本较低,但结果中往往有很多分支。第一代DNA条形码树的物种分辨率相对较高,但同一物种数量较多的分辨率仍然有限。叶绿体作为第二代DNA条形码,可以有效提高物种分辨率,在重建某些特定类群的系统发育关系方面取得了较好的效果。然而,将叶绿体应用于群落水平研究的效果尚未得到检验。
中国科学院华南植物园分子生态学团队及其合作者基于中国森林监测网(CForBio)平台,利用V.PhyloMaker、第一代DNA条形码片段(matK rbcL trnH-psbA)和叶绿体基因组79个蛋白编码基因,分别构建了亚热带常绿阔叶林区6个大尺度动态监测样地580种木本植物的群落系统发育树,比较了不同建树方法对系统发育多样性指数和功能性状系统发育信号计算结果的影响。研究表明,利用叶绿体基因组作为第二代DNA条形码构建群落系统树明显优于第一代DNA条形码片段。以叶绿体基因组树为参照,与目录树相比,基于第一代DNA条形码树的功能性状的系统发育多样性指数和系统发育信号更为准确。建议在同种比例较高的群落中,尽可能使用分辨率较高的叶绿体基因组树,以获得更准确的指数计算和生态推断结果。
相关研究成果最近发表在《分子生态资源》杂志上。该研究得到了中国科学院战略试点科技项目(B类)和国家自然科学基金的支持,各监测平台的工作人员在标本采集和物种鉴定过程中提供了支持和帮助。(100yiyao.com)
版权声明
本网站标注“来源:百医网”或“来源:bioon”的文字、图片、音视频资料均属于百医网网站版权所有。未经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,否则将承担责任。获得书面授权转载时,必须注明“来源:百医网”。其他来源的文章均为转载。本网站所有转载都是为了传递更多信息。转载不代表本网站的立场。不想被转载的媒体或个人可以联系我们,我们会立即删除。
87%的用户在阅读、评论和评论
医药网新闻
- 相关报道
-
- 《自然》:减重影响真的很大!科学家分析近20万细胞,发现减重可逆转肥胖导致的细胞衰老,但促炎巨噬细胞持续存在,或为反弹原因 (2025-07-11)
- Nature头条:尼安德特人比我们想象的更聪明,比人类早10万年掌握“炼油”技术 (2025-07-11)
- 医保钱包开明地域再扩容,快来看看有您的他乡吗 (2025-07-10)
- STTT:上海九院李青峰/谢峰团队揭示巨痣/兽皮病致病新机制,并提出治疗新策略 (2025-07-10)
- Science重磅发现:人类成年后乃至老年时,大脑海马体中仍在持续产生新的神经元,有助于记忆和学习 (2025-07-10)
- 体脂率多少的男/女性最具吸引力?三项科学研究揭露“完美身材”:男性体脂率13-14%+肩腰比1.57;女性完美身材则更为严格 (2025-07-10)
- STTT:中科院/南开团队发现,膜蛋白TfR1可入核“劫持”p53,增强癌细胞DNA损伤修复功能,对抗化疗 (2025-07-10)
- Nat Commun:大脑“幕后操控者”现身!科学家揭秘纹状体星形胶质细胞如何影响机体肥胖与代谢? (2025-07-09)
- Gut:四川大学团队发现肠癌“催肥肝脏”,为后续肝转移作铺垫的关键机制 (2025-07-09)
- 解读:制止将“空肠回肠吻合术”利用于2型糖尿病医治 (2025-07-09)
- 视频新闻
-
- 图片新闻
-
医药网免责声明:
- 本公司对医药网上刊登之所有信息不声明或保证其内容之正确性或可靠性;您于此接受并承认信赖任何信息所生之风险应自行承担。本公司,有权但无此义务,改善或更正所刊登信息任何部分之错误或疏失。
- 凡本网注明"来源:XXX(非医药网)"的作品,均转载自其它媒体,转载目的在于传递更多信息,并不代表本网赞同其观点和对其真实性负责。本网转载其他媒体之稿件,意在为公众提供免费服务。如稿件版权单位或个人不想在本网发布,可与本网联系,本网视情况可立即将其撤除。联系QQ:896150040