细胞报告:人类癌症预后生物标志物的全基因组鉴定和分析 |
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来源:100医疗网原创2022-04-20 16336049
准确区分侵袭性癌症和惰性癌症的能力是预测患者风险的基础,并可以指导关键的治疗决策。
准确区分侵袭性癌症和惰性癌症的能力是预测患者风险的基础,并可以指导关键的治疗决策。对于良性癌症,仔细等待和/或手术切除可能是合适的,而浸润性癌症可能需要采用细胞毒性疗法的多模式治疗,这本身将导致相当高的发病率。
癌症的治疗不足和过度治疗已被确定为患者死亡的重要原因,这突出表明迫切需要提高我们准确识别最具侵袭性的恶性肿瘤患者的能力。
目前,风险预测在很大程度上取决于对疾病状态的组织病理学和放射学评估。淋巴结转移和细胞去分化的存在被认为是患者预后的有力预测因子,并用于确定癌症的阶段和等级。然而,这些病理标记需要主观判断,观察者之间的符合率较低。此外,即使是一个完美的肿瘤分期也不能清楚地预测一个患者随后的临床病程。
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最近,耶鲁大学医学院的研究人员在《细胞报告》杂志上发表了一篇题为《人类癌症预后特征的全基因组识别和分析》的文章。该研究和分析为预后生物标志物的分析建立了丰富的资源,并阐明了患者存活数据在临床前癌症研究和治疗开发中的应用。
癌症的临床决策取决于对患者风险的准确评估。为了提高我们识别最具侵袭性的恶性肿瘤的能力,研究人员利用10,884名患者的基因表达、拷贝数、甲基化和突变数据构建了一个全基因组生存模型。
研究人员已经确定了超过10万个重要的预后生物标志物,并证明这些基因组特征可以预测患者的预后,即使临床上不清楚。尽管不利的生物标志物通常被认为代表癌症驱动因素和有希望的治疗靶点,但研究人员已经表明,与较短生存期相关的癌症特征不会对癌基因或成功的药物靶点产生丰富的影响。
相反,最强的坏生物标记代表广泛表达的细胞周期和基因,因此,几乎所有针对这些特征的治疗在临床试验中都失败了。
人类癌症预后特征的全基因组鉴定和分析
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在理想的生物标志物发现研究中,每个队列中的患者将接受统一的治疗,从而将患者间差异的潜在来源降至最低。作为TCGA分析的一部分,患者接受了不同的治疗,这可能会混淆预后生物标志物的识别。
此外,TCGA的一些癌症类型包括不到100名患者,这可能使他们无法进行全面的生物标志物识别。尽管有这些限制,研究人员注意到我们的分析正确地总结了许多既定的预后特征,包括患者年龄、肿瘤分级、肿瘤分期、TP53突变、细胞周期基因表达等。最后,本研究中的每种癌症类型都由一个患者队列来代表。在临床应用之前,任何感兴趣的单个生物标志物都应该在多个独立的队列中进行验证。(100yiyao.com)
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