喷鼻港年夜学Kelvin Kai |
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8月,喷鼻港年夜学Kelvin Kai-Wang To 博士团队应用孔手持便携式测序仪MinION停止全基因组测序,联合ARTIC和Medaka任务流程剖析,发明全球首例COVID-19康复者二次沾染病例,剖析显示两次沾染病毒分歧。
对两次沾染的病毒停止剖析发明初次沾染的病毒基因组属于GISAID V分支、Nextstain19A分支,穿山甲系B.2,二次沾染的病毒基因组属于GISAID G分支、Nextstrain 20A分支和穿山甲系B.1.79。初次沾染的病毒基因组因为开放浏览框8的第64位多了一个终止暗码子招致基因组上发生了50个氨基酸的缺掉,除此之外,两个病毒基因组还存在别的23个核苷酸的差别,个中有13个非同义渐变惹起氨基酸渐变。两个基因组的氨基酸差别次要表示在棘突卵白、膜卵白、核卵白、非构造卵白(NSP3、NSP5、NSP6、NSP12)和帮助卵白(ORF3a、ORF8和ORF10)。
8月25日,《临床沾染病》(Clinical Infectious Diseases)承受了该团队题为“COVID-19re-infection by a phylogenetically distinct SARS-coronavirus-2 strain confirmedby whole genome sequencing”的文章。(100yiyao.com)
【直播预告】孔测序在人类学和罕有病研讨中的使用
【日期】2020/11/19 15:00
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