佛手瓜基因组及其果实发育研讨畛域取得停顿 |
近日,北京市农林迷信院蔬菜中间(国度蔬菜工程技术研讨中间)左进华副研讨员团队与英国诺丁汉年夜学Donald Grierson传授 (英国皇家迷信院院士、中国工程院外籍院士) 团队结合在农林迷信Q1区Top期刊Horticulture research(IF:5.404)在线颁发了题为Combined genomic, tranomic, and metabolomics analyses provide insights into chayote (Sechium edule) evolution and fruit development的研讨论文,该研讨提醒了佛手瓜基因组构成和退化关系以及果实成长发育的分子调控机理,填补了佛手瓜在基因组、转录组和代谢组研讨畛域的空缺。国内出名园艺作物基因组学研讨出名迷信家、美国康奈尔年夜学Boyce Thompson研讨所费章君传授对此项研讨结果进行了点评,以为此项研讨是葫芦科动物研讨畛域极为紧张的突破,相关点评在“nature自然科研”"大众号宣布。
佛手瓜因瓜型似“佛手”而得名,有绿色无刺、绿皮有刺、白皮无刺和白色有刺四个种类,果实富含多种生物活性物资,且具备降血压、降血糖、保肝、避免动脉粥样软化和脂肪肝、延缓多种慢性疾病的功能,极具食用和药用代价。本研讨初次宣布了高质量的佛手瓜基因组,其基因组组装年夜小为606.42Mb,包括473个contigs和103个scaffolds,N50长度别离为8.40Mb和46.56MB,基因组中65.94%为反复序列,含有28237个卵白质编码基因。通过基因组比拟阐发和体系发育阐发,发现佛手瓜与蛇瓜的亲缘关系最为亲密,并在27-45百万年前由它们的独特祖先分解而来,研讨还发现佛手瓜在25±4百万年间产生了一次全基因组复制变乱。
此外,通过对佛手瓜果实发育的3个分歧成长期转录组和代谢组学研讨,鉴定出了在佛手瓜成长发育进程中与果实动物激素、质地、风味、类黄酮生物合成和抗氧化性相关的差别表白基因和差别代谢物;进一步对动物激素旌旗灯号转导路径和苯丙烷生物合成路径进行阐发,说明了佛手瓜成长和类黄酮合成的调控机制,并构建了佛手瓜果实成长发育的调控模子。本研讨为葫芦科动物的基因组退化和果实成长发育调控机理研讨提供了实际根据。 (100yiyao.com)
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