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Nature Genetics:化疗之后,我们健康的血细胞付出了怎样的代价?

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生命之河的源头:我们血液世界的秘密

在深入这场关于 化疗伤痕 的探索之前,我们必须先了解我们身体里那条永不停歇的 生命之河 血液 是如何运作的。这条河流的源头,深藏于我们的骨髓之中,那里居住着一群神奇的 始祖细胞 ,它们被称为造血干祖细胞 (Hematopoietic stem and progenitor cells, HSPCs)。

这些HSPCs是我们所有血细胞的共同祖先,包括负责运输氧气的红细胞、构成防线的白细胞(如淋巴细胞、单核细胞等)以及参与凝血的血小板。HSPCs拥有一项非凡的能力:自我更新与分化。它们既能复制出更多的自己,维持 源头 的永不枯竭;也能分化成各种功能各异的成熟血细胞,补充到血液循环中。这个过程周而复始,确保我们生命活动的正常运转。

然而,细胞的每一次分裂,都伴随着微小的风险。细胞内的DNA在复制过程中,偶尔会出错,就像抄写员在抄写一部鸿篇巨著时,难免会写错一两个字。这种DNA序列上的永久性改变,就是体细胞突变 (somatic mutation)。

这些突变大多是无害的,但它们会随着年龄的增长而不断累积。研究早已揭示,这是一个相当稳定的过程。一个健康成年人的HSPCs,平均每年会稳定地增加大约18个单碱基替换 (Single-Base Substitution, SBS),这是最常见的突变类型。这意味着,一位健康的80岁老人,其单个HSPC中大约携带着1500个这样的 岁月印记 。这个数字,就像一把衡量细胞 生理年龄 的尺子,为我们提供了一个至关重要的基准。

有了这把尺子,研究人员便可以开始回答那个核心问题:当化疗这股强大的外部力量介入时,这把尺子上的刻度,会发生怎样的剧变?

基因组考古学:巧妙的设计揭示细胞的过往

想要知道化疗究竟做了什么,研究人员必须像考古学家一样,发掘并解读细胞基因组中埋藏的历史信息。他们采用了一种极其巧妙的研究策略。

首先,他们招募了一个特殊的群体:一共23位曾接受过化疗的癌症患者,他们的年龄跨度极大,从3岁到80岁不等。这些患者所患的癌症类型多样,包括、、等;他们接受的化疗方案也五花八门,涵盖了我们熟知的几乎所有主要化疗药物类别,例如烷化剂 (alkylating agents)、铂类药物 (platinum compounds)、抗代谢药物 (antimetabolites)等,总共涉及21种不同的药物。与此同时,他们还招募了9位未接受过化疗的健康人作为对照组。

接下来是最关键的一步:单细胞基因组测序。研究人员从这些志愿者的血液或骨髓中,小心翼翼地分离出单个的HSPCs。然后,他们在培养皿中为这些孤独的细胞提供完美的生长环境,让每一个HSPC都分裂、增殖,形成一个由成千上万个细胞组成的 克隆集落 (colony) 。这个集落里的所有细胞,都拥有与最初那个HSPC完全相同的基因组(除了培养过程中可能产生的极少量新突变外)。

这种 单细胞扩增 的策略,巧妙地解决了单个细胞DNA量太少而无法测序的难题。随后,研究人员对这些集落进行全基因组测序 (Whole-Genome Sequencing, WGS),从而获得了每一个原始HSPC的完整基因图谱。通过比较同一个体不同HSPC之间的突变差异,他们得以构建出这些细胞的 家族树 ,也就是系统发育树 (phylogenetic tree)。这棵树的树根代表着受精卵,树枝的每一次分叉都代表着一次新的突变事件,而树梢则代表着今天我们看到的这些HSPCs。树枝的长度,则精确地记录了突变的数量。

通过这套方法,研究人员不仅能看到每个细胞里有多少突变,还能追溯这些突变是在生命中的哪个阶段、由什么原因造成的。一场针对化疗 罪证 的基因组级别的大侦探开始了。

第一波冲击:化疗引发的 突变风暴

当测序结果呈现在眼前时,其震撼力是毋庸置疑的。研究人员发现,在23名化疗患者中,高达17人的HSPCs基因组中,出现了远超其年龄应有水平的突变数量。

数据显示,有4位患者的情况最为严重,他们的HSPCs中,由化疗额外引入的突变数量超过了1000个。另外13位患者,也承受了中等程度的损伤,其HSPCs中额外增加了200到600个不等的突变。这意味着,他们的血细胞在短短的治疗周期内,经历了正常情况下需要几十年甚至更长时间才能完成的 衰老 过程。

其中一个案例尤为令人心惊。一位年仅3岁的患儿,在接受了包含 (carboplatin)和顺铂 (cisplatin)等药物的化疗后,其HSPCs中的体细胞突变总数,竟然已经超过了一位80岁健康老人的平均水平。换句话说,化疗让这个孩子的血细胞在基因组层面上, 一瞬间 衰老了近80年。

这些冰冷的数字,无声地诉说着化疗药物在杀死癌细胞的同时,对正常组织造成的巨大附带伤害。然而,研究人员也注意到,并非所有化疗药物都是 冷血杀手 。有6位患者的突变水平与正常人无异,这暗示着化疗的遗传毒性存在着巨大的药物依赖性。这究竟是为什么?研究人员需要更精细的工具来 指认凶手 。

化学指纹:锁定造成损伤的 元凶

不同的致突变物,会在DNA上留下独特的 犯罪痕迹 ,这被称为突变印记 (mutational signature)。它就像一个人的指纹,具有高度的特异性。例如,阳光中的紫外线主要导致C T的突变,且有其特定的序列偏好。通过分析基因组中成千上万个突变的模式,研究人员就能推断出导致这些突变的 元凶 。

在这项研究中,研究人员从所有样本的基因组数据中,成功提取出了12种不同的单碱基替换(SBS)突变印记。其中4种是已知的、在正常人体内存在的印记,比如与衰老相关的SBS1和SBS5,以及一种血液细胞特有的印记SBSBlood。

而真正激动人心的发现,是另外8种全新的、几乎只在化疗患者体内出现的突变印记。这些印记就是化疗药物留下的无可辩驳的 化学指纹 。通过将这些指纹与患者的用药史进行比对,研究人员成功地将它们与具体的药物一一对应起来:

SBSA印记:主要特征是T A的突变。它被发现于两位曾使用丙卡巴肼 (procarbazine)治疗的患者体内。丙卡巴肼是一种烷化剂,这个发现证实了它强大的致突变性。

SBSC、SBSD、SBSE印记:这三种印记模式相似,都与一类被称为氮芥类 (nitrogen mustard)的烷化剂有关。SBSC的 指纹 指向了苯丁酸氮芥 (chlorambucil);SBSD的 指纹 则指向了苯达莫司汀 (bendamustine);而SBSE的 指纹 则与美法仑 (melphalan)的使用高度相关。

SBSF印记:这个印记与铂类药物的暴露紧密相连,在接受过顺铂 (cisplatin)和卡铂 (carboplatin)治疗的患者中尤为明显。

SBSG印记:它的 指纹 则清晰地指向了抗代谢药物5- (5-fluorouracil, 5-FU)及其口服前体药物 (capecitabine)。

这些发现,就像是在一场复杂的犯罪现场,侦探通过分析弹道痕迹,准确地识别出了不同型号的凶器。它首次从基因组层面,为不同化疗药物的遗传毒性 画像 ,并建立了直接的因果联系。

同类不同命:为何 相似 的药物,毒性天差地别?

这项研究最具有临床指导意义的发现之一,在于它揭示了即便是同一类别的化疗药物,其长期遗传毒性也可能存在天壤之别。

以铂类药物为例,它们是治疗多种实体瘤的核心药物。研究发现,顺铂和卡铂会留下大量的SBSF突变印记,导致显著的基因组损伤。然而,同为铂类药物的奥沙利铂 (oxaliplatin),即便在一些患者体内使用了长达22个周期,其造成的SBSF突变也微乎其微,几乎可以忽略不计。

这一发现令人振奋。在许多临床场景中,这几种铂类药物在疗效上可以相互替代。这意味着,如果一位患者的治疗方案有选择空间,医生或许可以优先考虑使用奥沙利铂,从而在保证疗效的同时,极大地降低对正常血细胞的长期遗传损伤,减少未来发生继发性肿瘤的风险。

类似的故事也发生在烷化剂中。美法仑、苯达莫司汀和苯丁酸氮芥都显示出强大的致突变能力。但另一位同类药物 (cyclophosphamide),却表现得异常 温和 。在接受过环磷酰胺治疗的患者中,研究人员只观察到极少量的额外突变。

这背后的原因可能是什么?研究人员推测,这与细胞的解毒能力有关。HSPCs细胞内含有一种高水平的酶,名为醛脱氢酶 (aldehyde dehydrogenase),这种酶恰好能够高效地将环磷酰胺的活性代谢产物分解为无毒物质,从而保护了HSPCs免受其伤害。

这些 同类不同命 的案例,为我们打开了一扇通往 化疗 或 低毒化疗 的大门。未来的化疗方案设计,或许不再仅仅是疗效和短期毒性的权衡,更可以基于基因组损伤的考量,做出更长远、更人性化的选择。

不平等的战场:为何不同血细胞的 伤势 各不相同?

化疗药物进入血液,会流经全身,但它们对不同类型血细胞的攻击,似乎也存在 偏好 。为了探究这一点,研究人员利用流式细胞分选技术 (flow sorting),从患者血液中精确地分离出不同种类的成熟血细胞,包括单核细胞 (monocytes)、B淋巴细胞 (B cells)、记忆T淋巴细胞 (T memory cells)和初始T淋巴细胞 (T naive cells),并对它们进行了深度测序。

结果再次带来了惊喜。不同药物的 攻击偏好 差异巨大:

5-氟尿嘧啶/卡培他滨 (SBSG印记):这种药物对造血源头的HSPCs和单核细胞几乎 视而不见 ,突变负担极低。然而,它却对淋巴细胞(B细胞和T细胞)痛下杀手,在这些细胞中造成了显著的突变累积。这可能是因为淋巴细胞的代谢途径或DNA修复机制,使它们对这种模拟胸腺嘧啶的药物尤为敏感。

铂类药物 (SBSF印记):情况恰好相反。铂类药物对HSPCs和单核细胞造成了最严重的打击,但在T细胞中造成的突变则相对较少。

这种细胞类型的特异性损伤模式,揭示了一个更为复杂的画面。化疗的长期影响,不仅取决于药物本身,还取决于受攻击细胞的内在生物学特性,包括它们的代谢状态、DNA修复能力和细胞分裂速率。理解这些差异,将有助于我们更准确地预测和特定化疗方案可能带来的长期风险,例如针对免疫系统的损伤。

时间的加速器:化疗如何让年轻的血液 未老先衰

除了直接增加突变数量,化疗还以另一种更隐蔽、也更深刻的方式,改变了我们的血液世界 它重塑了血细胞的克隆结构 (clonal architecture),让整个系统出现了 未老先衰 的迹象。

在正常衰老过程中,随着突变的自然累积,HSPCs中偶尔会出现一些携带 优势突变 的细胞。这些突变(例如在DNMT3A、TET2等基因上)赋予了细胞微弱的生长或生存优势,使其后代在HSPCs群体中逐渐占据主导地位,形成一个庞大的 克隆 。这种现象被称为意义不明确的克隆性造血 (Clonal Hematopoiesis of Indeterminate Potential, CHIP),在70岁以上的老年人中非常普遍。

一位健康的48岁个体,其HSPCs的 家族树 看起来枝繁叶茂、多样性极高,几乎看不到任何一个克隆占据绝对优势。而一位77岁的健康老人,其 家族树 则呈现出几支巨大的 主干 ,这些就是由CHIP克隆扩张形成的。

然而,当研究人员观察那些化疗患者的 家族树 时,他们看到了令人不安的景象。一位48岁的女性患者 (PD47703),她在10岁时因霍奇金淋巴瘤接受过化疗,47岁时又因其他疾病再次化疗。她的HSPCs系统发育树,看起来完全不像一个中年人,反而更像是一位耄耋老人,充满了大大小小的扩张克隆。同样,一位43岁的女性患者 (PD37580),在长期使用苯丁酸氮芥后,其血液的克隆结构也呈现出典型的 老年化 特征。

更关键的是,化疗催生的这些 优势克隆 ,与正常衰老产生的克隆,在驱动基因上存在本质不同。正常衰老催生的大多是携带DNMT3A或TET2突变的克隆,而化疗这片 焦土 上顽强生长起来的,则主要是那些携带DNA损伤应答 (DNA damage response)通路相关基因突变的克隆,尤其是PPM1D和TP53基因。

这其中的逻辑不难理解。化疗通过制造大量的DNA损伤来杀死细胞。如果一个HSPC恰好发生了一个PPM1D或TP53的突变,这个突变可能会让细胞对DNA损伤 麻木 ,从而在化疗的轮番轰炸中幸存下来。当其他 遵纪守法 的细胞大量死亡时,这些 作弊 的细胞就获得了巨大的生存空间,迅速扩张,主宰了整个造血系统。

这种 过早衰老 的血液系统,潜藏着巨大的风险。一方面,这些携带PPM1D突变的克隆本身可能会削弱骨髓的再生能力。另一方面,TP53突变是众所周知的癌症驱动基因,它的扩张,大大增加了患者未来患上治疗相关的继发性白血病 (therapy-related leukemia)的风险。这恰恰解释了为什么部分癌症患者在多年后会罹患第二种、且往往更具侵袭性的血液肿瘤。化疗,在无意中为这些危险的细胞铺就了通往王座的道路。

解读伤痕,是为了开创更安全的未来

这项里程碑式的研究,为我们描绘了化疗对正常血细胞造成的长期、深刻且复杂的伤害。它告诉我们,化疗的代价,远不止于那些我们能看到或感受到的短期副作用。在基因组的层面上,它留下的伤痕可能会伴随患者的一生。

然而,这项研究的目的绝不是为了制造恐慌,更不是要否定化疗在癌症治疗中的基石地位。恰恰相反,看清风险,是为了更好地规避风险。这些发现为我们指明了优化癌症治疗、保障患者长期健康的康庄大道。

首先,它为优化化疗方案提供了全新的视角。当面临多种药物选择时,我们可以将 长期遗传毒性 作为一个重要的考量指标。选择像奥沙利铂或环磷酰胺这样 更温和 的药物,可能在不牺牲疗效的前提下,为患者赢得一个更健康的未来。

其次,它为癌症患者的长期健康管理提供了强大的工具。通过在化疗后对患者的血液进行基因测序,医生可以评估其突变负担和克隆结构,识别出那些携带高风险突变(如TP53)的 危险克隆 。这使得主动监测和早期干预成为可能,从而将继发性肿瘤扼杀在摇篮里。

最后,这项研究也向我们提出了一个更宏大的议题。随着医学的进步,癌症患者的数量日益增多。如何管理他们的长期健康,如何减轻治疗带来的 后遗症 ,是整个社会和医学界面临的共同挑战。这项研究,正是应对这一挑战的坚实一步。

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