土壤生物生化:研究提出了土壤微生物群落定量研究的优化策略

来源：农业资源与农业区划研究所2022-03-14 15:31

近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出了土壤微生物群落定量研究的优化策略。相关结果发表于《土壤生物学与生物化学（Soil Biology Biochemistry）》。微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中起着关键作用。随着高通量测序等技术的革命性突破，我们对微生物多样性和群落结构的了解大大增加。

近日，中国农业科学院农业资源与农业区划研究所植物营养团队研究提出了土壤微生物群落定量研究的优化策略。相关结果发表于《土壤生物学与生物化学（Soil Biology Biochemistry）》。

微生物群落的组成和功能在人类健康、全球元素循环、作物生长和植物抗病中起着关键作用。随着高通量测序等技术的革命性突破，我们对微生物多样性、群落结构和物种组成的了解大大增加。而测序数据只提供了微生物群落的相对丰度变化，忽略了微生物绝对数量的变化规律。针对高通量测序数据的这一缺陷，研究人员发展了多种微生物绝对丰度的定量方法，如内标法(spike-AMP)、荧光定量法结合高通量测序(qPCR-AMP)、流式细胞术结合高通量测序(FCM-AMP)等。然而，这些定量方法的普遍适用性和准确性仍不清楚。

研究团队使用黑龙江海伦和海南三亚两个不同的土壤样品，对土壤微生物研究中最常用的两种绝对定量方法，即内参法和结合高通量测序的荧光定量法进行了评价。结果表明，内参法在准确性、稳定性和工作量方面没有表现出任何优势。相比之下，更常用的荧光定量方法与高通量测序相结合的方法为环境干扰对土壤微生物动力学的影响提供了有价值的见解。考虑到其稳定性和技术可行性，结合荧光定量法和高通量测序法可以广泛应用于土壤微生物群落的定量研究。(100yiyao.com)

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