Nat Commun:抗生素耐药基因的全球健康风险评估 |
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来源:原创2022-04-01 07336039
抗生素耐药性日益威胁着全球人类健康和疾病的临床治疗。在过去的十年中,抗生素耐药基因(ARGs)在所有的自然、工厂和临床环境中都被检测到。抗生素的临床治疗是抗生素耐药基因传递的主要驱动因素。目前,科学家发现许多基因可以提供耐药性,但评估ARGs的相对健康风险是复杂的。ARGs的丰度、水平传播的趋势和在病原体中的表达能力等因素都很重要。最近,浙江工业
抗生素耐药性日益威胁着全球人类健康和疾病的临床治疗。在过去的十年中,抗生素耐药基因(ARGs)在所有的自然、工厂和临床环境中都被检测到。抗生素的临床治疗是抗生素耐药基因传递的主要驱动因素。目前,科学家发现许多基因可以提供耐药性,但评估ARGs的相对健康风险是复杂的。ARGs的丰度、水平传播的趋势和在病原体中的表达能力等因素都很重要。近日,浙江工业大学钱海峰研究组在Nat Commun上发表了一篇名为《抗生素耐药基因全球健康风险评估》的学术论文,全面评估了抗生素耐药基因的全球临床治疗风险。
在这项研究中,研究人员使用4572个宏基因组数据集来揭示2561个ARGs及其宿主在全球栖息地的分布和传播。然后,构建一个框架,通过测量人类可及性、移动性、人类致病性和临床可用性四个指标,定量评估每个ARG和样本的健康风险。最后,机器学习用于预测和绘制海洋栖息地的抗生素耐药性威胁。
结果发现,在不同生境(6个生境,4572个样品)的宏基因组水平上检测到2561个ARGs,它们对24种抗生素具有抗性。人类活动,如抗生素的使用,是ARG全球传播的关键。为了进一步确定人类活动对ARGs分布和丰度的影响,他们计算了每个样本点的种群密度。结果表明,不同的ARGs与人类活动的相关程度不同,会影响ARGs对人类生命的健康风险。然后分析四个指标(人类可及性、移动性、人类致病性和临床可利用性)来定量评估每个ARG的健康风险,即ARG会干扰病原体临床治疗的风险。结果显示,23.78%的ARG具有健康风险,尤其是具有多药耐药性的ARG。他们还计算了四个主要栖息地的所有样本的抗生素耐药性风险,并通过机器学习成功绘制了全球海洋栖息地的抗生素耐药性威胁,准确率超过75%。
图1 .全球海洋生境抗生素耐药性威胁分布图
这种定量监测ARGs健康风险的新方法将有助于管理对人类和动物健康最重要的威胁之一——抗生素耐药性。(100yiyao.com 100医疗网)
参考文献:张,张,秦,王,等。抗生素耐药基因的全球健康风险评估。第13,1553 (2022)号国家公报。
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