Nature:科学家揭示人类疾病中罕见蛋白质编码突变位点的遗传关联 |
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资料来源:科技部生物中心,2022-04-10 12:45
基于对两个大规模数据库的分析,本研究报告了大量疾病相关基因的新遗传变异,弥补了罕见低频等位基因频谱与疾病发生的关联。
全基因组关联研究已经确定了数千个与人类疾病风险相关的突变位点。但目前对罕见低频位点的相关性分析仍显不足,难以追溯该病的具体致病机制。
最近,一个由美国和英国研究团队组成的研究小组在《Nature》杂志上发表了一篇题为《人类疾病中蛋白质编码变异的遗传关联》的文章。通过对英国生物样本库(UKB)和芬兰基因库(FG)两个基因组数据库的分析,揭示了罕见突变与疾病之间的关联,为详细的致病性分析提供了基础。
研究团队整合了UKB和FG两大外显子组测序数据库(共653219个个体),对744个疾病表型进行了关联元分析,从而确定了975个基因遗传变异与疾病之间的关联,其中超过三分之一以前从未报道过。两个生物库的平行研究极大地扩展了对稀有基因和相关疾病研究的敏感性。将相关位点映射到基因后,发现482个基因与148个疾病簇相关。在这42个基因中,有13个基因座与至少5个疾病簇相关,表明这些基因具有基因多效性。例如,CHEK2基因除了被报道和相关外,还被发现与甲状腺癌、子宫平滑肌瘤、良性脑膜肿瘤和卵巢囊肿的风险相关。研究小组针对发现的遗传变异,对一系列不同的基因和信号通路进行了生物学研究,发现血凝素的两种罕见的遗传变异与肺栓塞有关。此外,研究小组还发现了一些多效性疾病位点。这些位点的发现为许多疾病提供了生物标记,可用于临床和药物开发。
基于对两个大规模数据库的分析,本研究报告了大量疾病相关基因的新遗传变异,弥补了罕见低频等位基因频谱与疾病发生的关联。
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