Nat Chem Biol ： 魏文胜团队实现蛋白质组中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析

氨基酸是组成蛋白质的基本单位，其突变可以通过多种方式影响蛋白质功能，进而影响细胞生存和多种疾病的发生发展。此前研究已证明，使用碱基编辑器进行内源性氨基酸替换，并结合细胞筛选来大规模研究其功能的可行性【1-3】。磷酸化是细胞中常见且重要的翻译后修饰，绝大多数发生在丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点上。目前已报道的大规模鉴定这三种氨基酸功能的研究主要依赖于预测【4】或仅聚焦于已被检测到可发生磷酸化的位点【5】。

考虑到蛋白组中依然存在大量潜在的磷酸化位点，且这三种氨基酸也介导了其它多种重要功能，实现在全蛋白组水平对这三种氨基酸位点的大规模功能鉴定具有重要意义。

北京大学生物医学前沿创新中心魏文胜团队在Nature Chemical Biology在线发表题为Functional profiling of serine, threonine and tyrosine sites的研究论文。

研究基于实验室此前开发的赖氨酸功能位点筛选策略【3】，利用腺嘌呤碱基编辑器对全基因组范围内的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点进行靶向编辑，并在人类视网膜色素上皮细胞系（RPE1）中进行了细胞筛选，成功鉴定出3,467个功能性氨基酸位点。这些位点的突变展示了与基因敲除类似或不同的表型，尤其是大量功能性位点位于敲除不影响细胞生长的基因上，展示了从单个氨基酸层面绘制蛋白组功能图谱的重要性。