Cell：新研讨发现超过14万种病毒生存在人类肠道中

2021年2月21日讯/BIOON/---病毒是地球上数目最多的生物实体。如今，在一项新的研讨中，来自英国韦尔科姆基金会桑格研讨所和欧洲生物信息研讨所（EMBL-EBI）的研讨职员鉴定出身活在人类肠道中的超过14万种病毒，此中一半以上的病毒曩昔从未见过。相关研讨成果颁发在2021年2月18日的Cell期刊上，论文题目为“Massive expansion of human gut bacteriophage diversity”。

图片来自Cell, 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.01.029。

这篇论文包括了对活着界各地搜集的28000多个肠道微生物组样本的阐发。这些研讨职员发现的病毒数目和多样性高得惊人，这些数据为相识生存在肠道中的病毒若何影响人类安康开发了新的研讨路径。

人类肠道是一个令人难以置信的生物多样性情况。除了细菌之外，那边还生存着数十万种可以感化的称为噬菌体的病毒。

众所周知，咱们肠道微生物组的失衡会招致疾病和简单的状况，如炎症性肠病、过敏和瘦削。但关于咱们的肠道细菌以及感化它们的噬菌体在人类安康和疾病中所饰演的脚色，人们相识得绝对较少。

这些研讨职员使用一种称为宏的DNA测序办法，对28060个公共人类肠道宏基因组和从人类肠道培育的2898个拆散株基因组中发现的病毒物种的生物多样性进行了摸索和编目。

他们的阐发鉴定出身活在人类肠道中的病毒品种超过14万种，此中一半以上因此前从未见过的。

论文独特作者、EMBL-EBI博士后研讨员Alexandre Almeida博士说，“紧张的是要记住并不是一切的病毒都是无害的， 它们代表了肠道生态体系的一个构成部门。起首，咱们发现的年夜多半病毒都以DNA作为物资，这与年夜多半人所熟知的病原体分歧，如SARS-CoV-2或寨卡病毒，它们是RNA病毒。其次，这些样本次要来自安康的个别，他们没有任何特别的疾病。察看到咱们的肠道中生存着若干未知的物种，并试图解开它们与人类安康之间的分割，这很吸惹人。”

在发现的恒河沙数的病毒中，他们鉴定出一个新的高度风行的分解枝---一组被以为有独特祖先的病毒，他们称其为Gubaphage。这是在人类肠道中发现的第二个年夜风行的病毒分解枝，仅次于2014年发现的crAssphage。

这两类病毒仿佛都邑感化类似类型的人类肠道，但要是没有进一步的研讨，很难晓得新发现的Gubaphage切实其实切功效。

论文独特通信作者兼论文第一作者、韦尔科姆基金会桑格研讨所的Luis F. Camarillo-Guerrero博士说，“咱们研讨的一个紧张方面是确珍重建的病毒基因组具备最高质量。严厉的质量节制管线加上机械培训办法，使得咱们可能加重净化并得到高度完全的病毒基因组。高质量的病毒基因组为咱们更好地相识病毒在咱们的肠道微生物组中饰演什么脚色摊平了路途，包含发现新的医治办法，如源自噬菌体的抗菌剂。”

这些研讨成果组成了肠道噬菌体数据库（Gut Phage Database, GPD）的根底。GPD是一个高度编撰的数据库，包括142809个非冗余噬菌体基因组，这将是研讨噬菌体及其在调理人类肠道和人类本身安康中作用的名贵资本。

论文独特通信作者、韦尔科姆基金会桑格研讨所的Trevor Lawley博士说，“噬菌体研讨今朝正在阅历一场中兴。这个高质量、年夜规模的人类肠道病毒目次来得恰是时分，可以作为指导将来病毒组（virome）研讨的生态学和退化阐发的蓝图。”（100医药网 100yiyao.com）

参考材料：

1.Luis F. Camarillo-Guerrero et al. . Cell, 2021, doi:10.1016/j.cell.2021.01.029.

2.Scientists identify over 140,000 virus species in the human gut

https://phys.org/news/2021-02-scientists-virus-species-human-gut.html