研究人员通过高质量的梅花鹿基因组序列揭示梅花鹿的食物偏好机制

来源：网络2022-09-05 09336052

近日，中国农业科学院特产研究所和深圳农业基因组研究所联合发布梅花鹿高质量全基因组组装序列，梅花鹿耐受有毒食物的分子机制研究取得重大进展。

近日，中国农业科学院和中国农科院联合发布梅花鹿高质量基因组组装序列，梅花鹿耐受有毒食物的分子机制研究取得重大进展。该版本基因组也是世界上首次公布的梅花鹿染色体水平的基因组。梅花鹿基因组序列的公布，开启了梅花鹿分子育种的新时代，为梅花鹿108个药用部位的物质基础分析奠定了坚实的基础。相关研究成果发表于《基因组蛋白质组与报（Genomics, Proteomics Bioinformatics）》。

梅花鹿自然分布于东亚，是东亚的旗舰物种。中国是梅花鹿资源、养殖和鹿产品消费大国。周期性再生鹿茸应用于人类保健已有2000多年的历史。研究人员发现，梅花鹿的分布与橡树的分布密切相关。梅花鹿喜欢吃橡树叶，在繁殖过程中适当添加橡树叶可以提高雌性梅花鹿的繁殖率和幼梅花鹿的成活率。然而，橡树叶富含单宁酸，而单宁酸对大多数哺乳动物是有毒的。因此，构建高质量的基因组序列数据并进行系统分析已成为解决梅花鹿有毒物质代谢分子机制的基础。

本文利用三代PacBio数据、Illumina数据和三维基因组Hi-C数据组装了一个高质量的梅花鹿参考基因组，染色体安装率高达99.24%。通过比较基因组学和转录组学数据分析，研究人员发现梅花鹿UGT2B基因家族的异常扩增是梅花鹿耐受高单宁食物的关键遗传基础。该基因亚家族在梅花鹿基因组中的显著扩展和在肝脏中的上调表达，在梅花鹿有毒物质的代谢中起着重要作用。

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