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《自然》:癌细胞是如何炼成的?科学家发现,TNF信号来源的转换是关键

来源:奇点糕 2024-07-24 10:20

在TSK细胞亚群中,这些自分泌来源的TNF会促进上皮-间质转化(EMT)的进展,并增强癌细胞的活动能力,使它们在肿瘤起始阶段更容易侵袭周围正常组织。

瑞士苏黎世大学研究者们在《自然》发表的最新研究成果[1],就为理解上皮细胞来源癌症的发生过程给出了重要方法和视角:研究者们开发了一种体内单细胞CRISPR测序策略,以追踪鳞状150个突变频率最高基因在上皮组织内的克隆动力学变化,由此发现肿瘤因子(TNF)信号是调控克隆扩增、促进肿瘤在早期侵袭周围组织的关键助力!

研究显示,影响上皮细胞来源癌症的TNF信号还可分为两个阶段,第一阶段即克隆扩增期的 信号源 是微环境中的巨噬细胞,但随后一部分也会激活自分泌TNF信号,使自身具有更强的侵袭性,检测TNF或许可以在病程相对早期的阶段,发现更多上皮来源癌症,实现癌症早诊以及对患者预后的预测。

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论文首页截图

为了实现在整个组织范围内监测克隆扩增的目标,研究者们改进了已有的CROP-seq系统(将基因盒中的嘌呤霉素换为红色荧光蛋白mCherry),并筛选了头颈鳞状细胞癌和皮肤鳞状细胞癌中最常变异的150个基因,以超声引导微注射法(使用怀孕小鼠的E9.5胚胎)构建相应的慢病毒CRISPR文库,再通过单细胞RNA测序收集所需信息。

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体内单细胞CRISPR测序策略的实现过程

研究者们首先对比了小鼠出生后第4天(P4)和第60天(P60)上皮内的小向导RNA(sgRNA)富集情况,发现富集的sgRNA主要靶向NOTCH1/2家族基因及FAT、TP53突变,与既往研究[2]结论相同,这就进一步证实了体内单细胞CRISPR测序策略的可靠性。

同时研究者们发现,经筛选出的150个鳞癌常见变异基因,在上皮细胞中如果有某个单独发生变异,其导致的基因表达改变大多就与TNF信号相关,且克隆扩增速率也与TNF信号速度存在正相关性,由此可见TNF信号的影响之深。经进一步分析,这些TNF主要是由正常上皮组织中的巨噬细胞分泌的,与上皮来源鳞癌细胞表面的TNFR1受体结合,才会发挥调控作用。

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TNF信号可调控上皮来源癌细胞的克隆扩增

但在癌症发生过程进展到肿瘤起始阶段时,TNF信号却成为了上皮来源鳞癌细胞中,强度下调最为显著的信号通路,难道它们的使命就此告一段落了吗?其实并不是,研究者们发现在这个阶段,上皮来源鳞癌细胞中仍有TNF蛋白表达,但来源却是与前面几乎完全不重合的一套 自分泌TNF基因程序 (26个基因中仅有3个重合),且主要见于一部分肿瘤特异性角质形成细胞(TSK)中。

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癌细胞可以切换到 自分泌TNF 程序,使TNF信号继续发挥作用

在TSK细胞亚群中,这些自分泌来源的TNF会促进上皮-间质转化(EMT)的进展,并增强癌细胞的活动能力,使它们在肿瘤起始阶段更容易侵袭周围正常组织。最后研究者们证实, 自分泌TNF基因程序 涉及的Mmp9等基因表达水平,与人类鳞癌患者不良生存预后明确相关,因此可将这些基因作为鳞癌检测、评估预后的标志物,乃至尝试。

参考文献:

[1]Renz P F, Ghoshdastider U, Baghai Sain S, et al. In vivo single-cell CRISPR uncovers distinct TNF programmes in tumour evolution[J]. Nature, 2024.

[2]Martincorena I, Roshan A, Gerstung M, et al. High burden and pervasive positive selection of somatic mutations in normal human skin[J]. Science, 2015, 348(6237): 880-886.

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