Nature ：“偷窥”大脑发育！次4D直播“迷你大脑”发育，竟发现决定大脑区域的不是基因而是“细胞胶水”

搭建 迷你大脑 的4D影院

想象一下，你想要拍摄一部关于城市建设的纪录片。如果你只用一台摄像机对着整个城市远距离拍摄，你可能只能看到模糊的轮廓。但如果你能同时在城市的各个角落安放无数个微型摄像头，分别记录建筑框架、管道铺设、电路连接和人员流动，你就能得到一幅无比生动和完整的画卷。

研究人员面临的挑战与此类似。传统的荧光标记方法，通常会将类器官中所有同类型的细胞都点亮，导致整个组织 亮成一片 ，内部精细的结构和单个细胞的行为都无法分辨，就像是在白天看星星。为了解决这个问题，研究团队设计了一套极其巧妙的 稀疏多重镶嵌标记 (sparse and multi-mosaic labelling) 策略。

稀疏标记 (sparse labelling)的理念很简单：与其标记所有细胞，不如只随机标记其中一小部分。研究人员将带有荧光标记的干细胞以大约2%的极低比例，与大量未标记的干细胞混合在一起。这样一来，在发育的类器官中，被点亮的细胞就像是夜空中的繁星，稀疏而清晰，彼此不会遮挡。这使得追踪单个细胞的运动、形态变化和邻里关系成为可能。

而多重镶嵌标记 (multi-mosaic labelling)则更进一步。研究人员并非只使用一种颜色的荧光笔，而是准备了五支不同颜色的 荧光笔 ，分别标记细胞的不同 器官 ：细胞核 (nucleus)，用绿色荧光蛋白 (GFP) 标记组蛋白 (histone)，显示细胞的 大脑 ；细胞骨架，用绿色荧光蛋白标记肌动蛋白 (actin) 或用红色荧光蛋白 (RFP) 标记微管蛋白 (tubulin)，展示细胞的 骨骼与肌肉 ；细胞膜 (plasma membrane)，用红色荧光蛋白标记CAAX蛋白，勾勒出细胞的轮廓；以及核膜 (nuclear envelope)，用红色荧光蛋白标记核纤层蛋白 (lamin)，描绘出细胞核的边界。他们将这五种不同标记的细胞系与未标记细胞混合，创造出一个五彩斑斓的 镶嵌体 。通过复杂的计算解复用 (computational demultiplexing) 技术，研究人员可以准确地识别出每一个信号来自哪一种结构。

有了这些精巧的 演员 ，还需要一个顶级的 摄影棚 。研究团队采用了光片显微镜 (light-sheet microscopy)。与传统显微镜用一束光从上到下穿透整个样品不同，光片显微镜从侧面用一片薄如纸张的光 切片式 地照亮样品。这种方法极大地降低了对细胞的光毒性，相当于用柔和的舞台灯光代替了刺眼的聚光灯，使得研究人员可以连续数周对类器官进行成像，而不会 烤伤 这些珍贵的样品。

最终，他们成功搭建了一个前所未有的 迷你大脑4D影院 。在这个影院里，他们不仅能看到组织宏观形态的演变，还能放大到单个细胞，观察其伸缩、迁移，甚至还能聚焦到细胞内部，看到细胞核的压缩、细胞骨架的重组。一部关于大脑如何 从无到有 的史诗级纪录片，即将上演。

首映礼 一部浓缩的 大脑 创世纪

当研究人员按下 播放 键，一场浓缩的 大脑 创世纪在我们眼前展开。

直播从第4天开始。此时的类器官还是一个由多能干细胞组成的、平平无奇的实心球体，被称为胚状体 (embryoid body)。然而，在接下来的几天里，戏剧性的变化发生了。到了第5天，球体内部开始出现一些微小的空腔，如同奶酪中的气孔。这些空腔就是未来脑室系统的雏形，被称为 管腔 (lumen) 。

随着时间的推移，这些管腔迅速扩张、融合，周围的细胞也开始变得不再 懒散 ，它们逐渐伸长，排列成一层整齐的、围绕着管腔的神经上皮 (neuroepithelium)结构，这是大脑皮层最原始的结构单元。

通过对16个类器官的并行成像和精确的定量分析，研究人员记录下了这一过程的详细数据。从第4天到第8天，类器官的总体积惊人地增长了四倍。更有趣的是管腔的变化：管腔的数量先是急剧增加，从第5天的平均3.7个上升到第6天的13.4个，随后又在腔室融合中减少到第7天后的平均5.4个。这表明类器官的发育并非简单的线性膨胀，而是一个动态的重塑过程，充满了合并与整合。

整个过程可以被清晰地划分为三个阶段：1. 早期快速生长阶段（第4-6天），组织体积和管腔数量、体积都迅速增加；2. 组织稳定化阶段（第6-7天），多个小管腔融合成少数几个大管腔，组织结构趋于稳定；3. 神经上皮成熟阶段（第7天以后），管腔体积略有收缩，而周围的神经上皮细胞则继续分化和成熟。

这些细致的观察，为我们描绘了一幅标准的人脑类器官早期发育路线图。然而，研究人员并未止步于此。他们敏锐地意识到，在标准的培养方案中，有一个看似普通却可能至关重要的步骤 在培养基中加入一种名为Matrigel的物质。这是一种富含细胞外基质 (Extracellular Matrix, ECM)的凝胶。细胞外基质，这个在教科书中常常被描述为细胞间 填充物 的东西，真的只是一个被动的支架吗？还是说，它才是这场发育大戏中，那位一直隐藏在幕后的真正导演？一个大胆的假设和一系列巧妙的实验，即将揭开一个惊人的秘密。

剧情反转 看不见的 基质 才是幕后推手

细胞外基质 (ECM) 并非简单的 细胞胶水 。它是一个由胶原蛋白、层粘连蛋白等多种大分子构成的复杂网络，不仅为细胞提供物理支撑，更是细胞间信息交流的高速公路。它能储存和释放生长因子，其自身的物理特性，如硬度、弹性，也能被细胞 感知 ，从而影响细胞的行为。

为了探究ECM在脑类器官发育中的确切角色，研究人员设计了三组对照实验：1. Matrigel组（标准组）：按照常规方法，在培养基中添加富含ECM的Matrigel。2. 无基质组 (no-matrix group)：完全不添加任何外源性的ECM，让类器官在液体培养基中 自由裸奔 。3. 琼脂糖组 (agarose group)：将类器官包裹在一层惰性的琼脂糖凝胶中。琼脂糖能像一个物理屏障，模拟部分包裹作用，但它本身不具备ECM的生物活性。实验结果令人震惊，三组类器官走向了截然不同的发育道路。

在Matrigel的 精心呵护 下，类器官发育得 又大又好 。它们体积更大，内部形成了宽阔、规则的管腔。更重要的是，细胞表现出高度的组织性。通过后续的单细胞转录组测序分析，研究人员发现，这些类器官主要发育成了类似前脑 (prosencephalon)，特别是端脑 (telencephalon)的结构 这正是人类大脑中负责高级认知功能的部分。

而那些在无基质条件下 野蛮生长 的类器官，则完全是另一番景象。它们个头更小，形态不规则，内部的管腔狭小而杂乱。细胞类型的分析结果更是出人意料：它们几乎没有发育成前脑，反而产生了大量的后脑（尾侧化，caudalized）组织和神经嵴细胞(neural crest cells)。神经嵴是在胚胎发育中产生的一类多能细胞，可以分化成周围神经系统、色素细胞和面部骨骼等，但在大脑皮层发育中通常不占主导。

琼脂糖组的结果则像一个 仲裁者 。这些类器官的发育介于前两者之间，这有力地证明了，Matrigel的作用不仅仅是提供一个物理性的包裹，其富含的ECM成分，通过其独特的生物化学和物理机械特性，主动地引导了类器官的命运。

这一发现是颠覆性的：外部的基质环境并非一个可有可无的 配角 ，而是决定大脑区域身份（前脑 vs 后脑）的 总开关 。

在ECM的引导下，迷你大脑走上了通往 智慧之巅 （前脑）的康庄大道；而在没有引导的混沌中，它则迷失方向，走向了更原始的 本能之路 （后脑和外周结构）。这就像是播种，同样的种子，种在肥沃、结构良好的土壤里，和撒在贫瘠的沙地上，长出的将是完全不同的植物。那么，ECM究竟是如何向细胞传递 指令 ，告诉它们应该成为 前脑 还是 后脑 的呢？研究人员决定继续深挖，寻找这个从物理环境到基因命运的分子信使。

揭开导演面纱 从物理 触感 到化学 指令

研究人员将目光锁定在两个著名的信号通路上：WNT信号通路和Hippo信号通路。WNT通路在胚胎发育中扮演着 区域规划师 的角色，其信号分子的浓度梯度，决定了身体前后轴（头-尾）和背腹轴的模式建成。而Hippo通路，特别是其下游的一个关键效应蛋白YAP1，则是一个著名的 力学传感器 (mechanosensor) 。

YAP1蛋白像一个灵敏的细胞内探针，能够感知细胞所处微环境的物理线索。当细胞感受到外部的机械压力或处于一个更硬的环境时，YAP1就会被激活，进入细胞核，像一个转录因子一样，启动一系列特定基因的表达。研究人员提出了一个大胆的假设：ECM的缺失，改变了类器官的力学微环境，这种改变被YAP1感知，从而启动了决定后脑命运的WNT信号通路。

一系列的分子生物学实验证实了这一猜想。首先，他们发现，在无基质培养的类器官中，细胞核内的YAP1蛋白水平显著高于Matrigel培养的类器官。接着，他们发现，YAP1的激活直接导致了一个名为WLS (Wntless)的基因的表达急剧上调。WLS蛋白是WNT信号分子分泌所必需的 搬运工 。高水平的WNT信号，正是胚胎发育中指定 尾部 或 后部 身份的关键指令。

至此，一条清晰的分子调控链条浮出水面：

无外源性ECM 细胞力学环境改变 YAP1蛋白被激活并进入细胞核 YAP1直接启动WLS基因的转录 WLS蛋白促进WNT信号分子的分泌 高浓度的WNT信号将类器官 尾侧化 ，使其发育成后脑和神经嵴组织。

这是一个石破天惊的发现。它完美地将物理线索（基质的有无）、力学传感（YAP1）和化学信号（WNT）这三个看似独立的层面，串联成一个决定大脑区域命运的因果链。

为了给这个结论提供 铁证 ，研究人员进行了基因敲除 (knockout)。他们利用CRISPR-Cas9基因编辑技术，在干细胞中敲除了WLS基因。结果正如预期：在没有外部基质的条件下，这些WLS基因敲除的类器官竟然 叛变 了！它们不再发生尾侧化，反而形成了更接近于Matrigel培养的、具有前脑特征的细胞群体。这个实验证明了，YAP1介导的WLS激活，是在没有外部基质时导致大脑类器官尾侧化的核心机制。

一扇窥探思想黎明的新窗口

通过这项里程碑式的研究，我们跟随研究人员的脚步，完成了一次对大脑发育奥秘的壮丽探索。

他们首先像一位高超的工程师，搭建了一座前所未有的 迷你大脑4D影院 ，通过稀疏多重镶嵌标记和长时程光片显微镜技术，让我们得以 身临其境 地观看大脑从一个细胞球塑造成复杂组织的全过程。

接着，他们像一位敏锐的侦探，通过精巧的对比实验，发现了长期被忽视的 嫌疑人 细胞外基质 (ECM)。他们揭示了，这个看似不起眼的外部环境，实际上是决定大脑区域身份（前脑vs后脑）的幕后主宰。

最后，他们像一位严谨的法官，通过一系列分子生物学和基因编辑的 审讯 ，锁定了从物理线索到基因命运的完整证据链。他们证明了，细胞通过YAP1这个 力学传感器 感知外部基质的物理特性，进而调控WLS/WNT这个 化学信号轴 ，最终决定了自身的命运归属。

这项工作不仅为我们理解大脑的早期发育提供了深刻的见解，更具有广泛的现实意义。它强调了在类器官研究中，模拟和控制其物理微环境的重要性，为未来培育出更逼真、更复杂的脑类器官模型指明了方向。这些更先进的模型，将成为研究自闭症、精神分裂症等神经发育性疾病的有力工具，也为药物筛选和再生医学带来了新的希望。

更重要的是，它让我们再次对生命的智慧肃然起敬。原来，一个能够思考宇宙的精密大脑，其最初的蓝图，竟部分地书写在细胞间那些无声的物理 触感 之中。每一次细胞间的挤压与牵拉，每一次与外部基质的轻柔接触，都可能是在低语着关于 成为谁 的古老密码。

这扇窥探思想黎明的新窗口已经被打开，透过它，我们看到的，是生命演化中最激动人心的篇章，也是通往理解我们自身起源的、充满无限可能的未来。

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