中国水产迷信研讨院珠江所叶星研讨员团队宣布首个年夜口黑鲈染色体程度基因组图谱

近日，珠江水产研讨所叶星研讨员团队完成了年夜口黑鲈染色体程度基因组精密图谱的绘制息争析，研讨论文“Chromosome-level genome assembly for the largemouth bassMicropterus salmoidesprovides insights into adaptation to fresh and brackish water”正式揭橥在国际主要学术期刊《Molecular Ecology Resource》上。

年夜口黑鲈（Micropterus salmoides）天然散布于北美海水流域，但在海岸咸海水情况中也有散布，是北美水生态零碎中具有主要生态学与经济学意义的黑鲈属主要成员之一。自1983年引进以来年夜口黑鲈已成为我国主要的养殖鱼类，2019年我国养殖产量达47.8万吨。为更好地懂得年夜口黑鲈的物种退化史、展开其主要性状根底的研讨以及种质资本开辟与应用，该团队展开了年夜口黑鲈基因组研讨。联合PacBio单分子及时测序与Hi-C技巧，取得了首个高质量染色体程度的年夜口黑鲈基因组。年夜口黑鲈基因组年夜小为964Mb，contig N50和scaffoldN50辨别为1.23Mb和36.48Mb。联合PacbioRNA测序一共正文出23，701个基因。

多半鲈形目鱼类单倍型染色体数目为24条，而年夜口黑鲈却仅有23条。本研讨经过比拟基因组剖析发明其1号染色体为交融染色体的证据：年夜口黑鲈的1号染色体辨别对应于花鲈的20和24号染色体、欧洲鲈的18-21和24-25号染色体，同时在年夜口黑鲈1号染色体的中上部24Mb处发明了高密度元件区域，提醒年夜口黑鲈1号染色体由2条端部着丝粒染色体交融所成，个中一个着丝粒能够丧失或退步。

论文还商量了年夜口黑鲈的咸海水顺应的分子机制。经过膨胀与扩大剖析、正选择剖析和转录组剖析，共发明年夜口黑鲈与离子调控相干基因294个。个中年夜口黑鲈闭合卵白基因分明扩大，发生27个家族成员共68个拷贝，该家族成员在调理细胞间慎密衔接，离子与水的进出、保持浸透压波动中发扬主要感化。年夜口黑鲈基因组精密图谱的完成，为其种质资本维护与改进、退化汗青及主要性状的研讨供给了主要的数据根底。

该期刊为生物化学与分子生物学、生态学范畴国际顶级期刊，中科院JCR分区生物学１区（Q1），IF为6.286。该研讨受古代农业家当技巧系统专项资金（CARS-46）和水科院科技立异团队项目标支撑。中国水产迷信研讨院珠江水产研讨所为论文第一完成单元，孙成飞博士与李佳博士为论文配合第一作者，叶星研讨员和石琼研讨员为论文配合通信作者。(100yiyao.com）