研讨提醒同源转座子维持一般小麦多倍体亚基因组高级构造稳定性

Genome Biology在线颁发中国迷信院分子动物迷信杰出立异中间张一婧研讨组与河南农业年夜学、中国农业迷信院和河南科技学院单干实现的题为Homology-mediated inter-chromosomal interactions in hexaploid wheat lead to specific subgenome territories following polyploidization and introgression的论文，通过解析矮抗58三维基因组提醒同源转座子参加维持一般小麦多倍体亚基因组高级构造稳定性。

染色体组多倍化是推进动物演变的紧张因素，是物种造成的次要路径之一。在环球普遍莳植的一般小麦（Triticum aestivum， 2n=6x=42， AABBDD）是颠末两次多倍化变乱造成的异源六倍体，含有三个相近但不完整雷同的亚基因组（A、B、D）。A、B、D亚基因组在细胞中绝对自力，减数决裂配对仅限于来自统一亚基因组的染色体伴侣，分歧亚基因组的同源染色体间普通不会产生配对。迄今为止，对亚基因组间和亚基因组内分歧染色体之间互作机制的摸索少有报道。

百农矮抗58（AK58，河南科技学院传授茹振钢培养胜利的小麦低劣种类）具备高产稳产、耐逆抗病、顺应性广等特色，其选育及利用得到2013年度国度科技提高一等奖。2015年以来，河南农业年夜学、中国农科院作物迷信研讨所与河南科技学院结合展开了AK58的基因组测序与阐发，基因组序列已在国际提早开释。该论文为AK58系列文章之一。

研讨通过火析染色质空间构造，发现AK58分歧亚基因组的染色质在细胞中绝对自力，亚基因组外部染色体之间的互作弘远于亚基因组间染色体的互作。联合基因组序列比拟，发现亚基因组外部染色体间的互作与亚基因组偏恶化座子的存在亲密相关，标明亚基因组特同性的转座子介导了亚基因组外部染色体间的高级构造互作。1BL/1RS易位染色体外部互作显明，但1RS与小麦其他染色体的互作显着下降，这或与其特别的转座子组成亲密相关。该研讨提醒了特异转座子参加维持多倍体亚基因组的稳定性及外源渗入染色体片断的自力性，以及特异转座子在稳定多倍体亚基因组进程中的紧张作用（模子图）。分歧的比对参数会得到完整分歧的论断，设置适宜的比对参数对研讨成果较为紧张，并提示阐发进程中可应用参数对成果的影响提醒深层的分子机理。(100yiyao.com）