云南怒江草果全基因组精密图谱绘制胜利 |
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从20世纪70年月开端,云南省怒江州就开端莳植草果,到2020年,莳植面积已达111万亩,不仅是全国草果的焦点产区,也是本地群众脱贫致富的紧张经济作物。
为了放慢进步草果改进效率,培养高产、抗病、优质、平安新种类,对从泉源立异保证草果家当安康可继续倒退,2019年9月,怒江州结合华南农业年夜学等国际外高校科研院所机构,正式启动草果全基因组测序筹划,历时1年零3个月,胜利实现草果全基因组测序任务,绘制了精密图谱,并于1月13日正式对外宣布。
通过Nanopore及illumina等测序技术,拼接组装获得2.08G年夜小的基因组,组装出由1145个contig序列构成的草果参考基因组序列,GC含量为40.9%,最长的contig长度为31.6Mb,N50为4.7Mb。联合HiC测序成果,获得24对染色体的高质量基因组,包含42394个基因。通过转录组、代谢组联系关系阐发,获得草果症结香气物资合成的候选基因一批。草果全基因组精密图谱实现将极年夜推进草果的全基因组精准育种,为打造国度级草果种质资本圃提供紧张根底作用。(100yiyao.com)
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