动物miRNA调控网络研讨取得停顿

北京年夜学性命迷信学院李磊研讨组在GPB杂志在线颁发了题为“Structural and Functional Analyses of Hub MicroRNAs in an Integrated Gene Regulatory Network of Arabidopsis”的研讨论文。本项研讨次要构建解析了形式动物拟南芥中一个认为中间的层级基因调控网络。GPB杂志是中国最具国内影响力学术期刊之一，由中国迷信院北京基因组研讨所与中国粹会独特主理。

MicroRNA（miRNA）是真核生物中内源性的一类具备调控功效的，通过碱基互补配对的方式辨认靶基因mRNA，指导缄默复合体降解靶基因mRNA或许阻挠其翻译，从而与转录因子指导的转录调控协同决议靶基因的时空表白形式。在动物中，miRNA对靶基因的转录后调控机制普遍存在，在成长发育与情况应对进程中发扬紧张作用。虽然通过办法对动物中单个miRNA的功效相识越来越多，然则对它们在基因调控网络中的整体作用方式以及与转录因子的互相关系仍旧所知甚少。在本项研讨中，基于对公共数据库中的数据进行从新阐发和整顿文献中已有的互相作用数据，构建了拟南芥中一个miRNA调控网络，此中包含66个焦点转录因子、318个miRNA和1712个上游靶基因以及它们之间的调控关系（图1）。

通过对网络构造的解析，研讨职员发现miRNA盘踞了与转录因子及靶基因分歧的地位，而且显着丰厚了含有miRNA的前馈环路（feed-forward loop），特殊是那些miRNA处于中心节点的环路。进一步的阐发成果显示，含miRNA的前馈环路与位于网络中分歧层级的转录因子互相协调，而且含miRNA的前馈环路在网络中的层级地位与构造和miRNA所处的层级无关（图2）。依据枢纽miRNA是影响多个生物进程照样只影响繁多生物进程，分为两品种型并别离定名为约会型枢纽miRNA和聚会会议型枢纽miRNA。以靶向多个MYB类转录因子的约会型枢纽MIR858A为例，对三个由MIR858A衔接的前馈环路进行了具体的分子和研讨。发现分歧的MYB靶基因别离参加花青素、木质素的合成，同时通过miR858承受分歧转录因子的调控。这些阐发不只提醒了所选择的前馈环路的生物学功效，并且说明了焦点miRNA发扬多种调控作用的网络根底。综合而言，该研讨发现了动物中含miRNA的前馈环路的广泛性和紧张性，对充沛解析动物miRNA生物功效、深化挖掘动物miRNA基因资本具备紧张意义。(100yiyao.com）