多个Nature子刊存眷热门

2020年10月19日，第19届人类组织天下网络年夜会（hupo2020.org）上，新一代4D卵白质组学技术因捕集离子淌度技术（TIMS）战争行积聚间断碎裂（PASEF ）办法的胜利贸易化而得到HUPO迷信技术奖。该奖项以表彰新的办法改动了迷信家研讨卵白质组学的方式，验证了timsTOF Pro使用短梯度的年夜行列步队深度4D-卵白质组学在转化医学中的利用。

同年2020年12月，卵白质组畛域领军迷信家Matthias Mann团队(Max Planck Institute of Biochemistry)、Hannes R st团队(University of Toronto)、Ben Collins团队（ETH Zurich）以及Ruedi Aebersold团队（ETH Zurich）在Nature methods（IF:30.822）颁发题为“diaPASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition”的文章，其独特开辟的基于4D平台的DIA技术——diaPASEF，可能全面提升卵白质鉴定笼罩率、重现性和定量精确性。

近年来，跟着组学技术在各个畛域的不时倒退，研讨者们关于各类组学技术的需乞降要求越来越高，愿望能同时统筹检测的通量、敏锐度及精确性，并能从分歧分子层面体系地进行整合阐发，从更全面更多维更深条理的角度去挖掘性命征象背地的机制及意义。

咱们鹿明生物也在后基因组期间的多组学海潮中，针对咱们已有的卵白组技术、代谢组技术不时地迭代降级，组合立异，愿望以最好的技术为迷信家们服务，为性命迷信研讨助力。上面一路来相识一下咱们的最新技术及最新福利运动吧！

1.4D-DIA技术

●技术引见

离子淌度拆散观点的引入使得卵白质组学进入了4D新期间。4D-Proteomics 是在3D拆散即保留光阴（retention time）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度的根底之上添加了第四个维度，离子淌度（mobility）的拆散，进而年夜幅度的进步扫描速率和检测敏锐度，带来卵白质组学在鉴定深度、检测周期、定量精确性等性能的全面提升。

DIA（Data-Independent Acquisition，数据非依赖采集）相较于DDA（Data-Dependent Acquisition，数据依赖采集）的办法通过将整个全扫描范畴分为多少个窗口，并轮回地对每个窗口中的一切离子进行碎裂和检测，削减了缺失值，信息更全面，定量精确且更稳定，无望在年夜样本行列步队中完成可反复和精确的卵白质组定量。

4D-DIA同时聚拢了4D卵白质组和DIA技术的劣势，可能全面提升卵白质鉴定才能、检测敏锐度和数据完全性，展示了其在卵白质组学畛域的弱小功效和普遍利用前景，具备划期间的严重意义。

●技术劣势

1.近乎100%的离子应用率，提升检测敏锐度；

2.更高的检测深度和笼罩度；

3.定量反复性、完全性、靠得住性全面提升。

2.LC-MS GC-MS非靶向代谢组学双平台

●技术引见

分歧的质谱平台敏锐度及方向性都纷歧样，并且分歧平台之间具备互补性。LC-MS平台对代谢物的笼罩最广、敏锐度更高，相比于GC-MS，无需衍生处置。LC-MS平台可以检测到的物资峰可以到达几千乃至上万，有定性信息的物资在1000个以上。GC-MS可以作为LC-MS热稳定化合物的一种弥补，普通GC-MS平台可以定性到的代谢物在200个以上。

鹿明生物通过优化的前处置办法并联合GCMS和LCMS平台各自劣势，同时配套多年积聚的领有自立产权的自建数据库，完成一份样本双平台检测，极年夜地进步了代谢物鉴定的数目和精确性，为您提供更全面更精准的代谢组学服务。

●平台劣势

1.性价比高，一份价钱双平台成果；

2.笼罩度广，从低级到次级代谢物全面笼罩；

3.数据库全，领有自立产权GCMS LUG库（2000+） 医学类LCMS自建库EMDB（3600+） 动物类LCMS自建库PMDB（6000+）；

4.质控严厉，从样本前处置质控，到残留评价、组间质控、组内质控、数据处置质控五年夜质控进程为成果保驾护航；

5.阐发丰厚，单/多维统计阐发、相关性阐发、通路阐发、特性化阐发。

3.卵白组代谢组结合阐发

对卵白组和代谢组两个分子条理的组学数据进行整合阐发，一方面可以联合两个组学的阐发成果，进行互相验证，进步后续试验验证胜利率；另一方面也有助于互相弥补，而且使研讨加倍体系。终极完成对生物变动年夜趋向与偏向的综合相识，提出分子生物学变动机制模子，并挑选出重点代谢通路相关的卵白质或许代谢产品，从而为后续进行深化试验与阐发提供数据根底。

基于新一代4D卵白质组学，研讨者将可能对简单样品的分子机制进行更深化的研讨、进步发现低品貌生物学紧张卵白质的能够性，并在转化医学、临床卵白质组学等研讨中具备普遍的利用前景，也标记着卵白质组学正式进入“4D 新期间”。

年夜家是否有以下迷惑：

4D-DIA技术若何助力您的科研，玩转热门研讨？

4D-DIA技术今朝的停顿与利用若何？国自然名目有哪些热门？

卵白组学4D-DIA技术若何联合代谢组学技术做结合研讨？

为此鹿明生物特邀布鲁克利用工程师杜潇贤老师和年夜家一路及时分享4D-DIA实战利用~（讲座内还有礼物抽奖环节不容错过哦~）

特邀高朋：

高朋简介

杜潇贤卒业于复旦年夜学。从事基于质谱的卵白质组学研讨，具备丰厚的组学试验，质谱和数据阐发教训，现任布鲁克利用工程师。

申报引见：

1、4D-卵白质组学原理和技术劣势；

2、dia-PASEF 技术原理引见和技术停顿；

3、4D-卵白质组学最新技术停顿

方后琴 ：卒业于同济年夜学，从事卵白质组学行业8年，具备丰厚的卵白组研讨教训，熟识DIA、标志定量及Labelfree等多品种型的质谱试验及数据阐发办法，以一作在《Analytical Chemistry》期刊上颁发学术论文1篇，得到国度创造专利受权2项。

申报引见：

1、DIA原理、技术特色及研讨流程；

2、4D-DIA技术及最新研讨停顿；

3、4D-DIA技术在卵白质组学中的利用；

钟晓彬：鹿明生物华南区产物司理，担任华南区科研服务市场推行经营，从事多组学试验研讨6年，善于代谢组试验方案设计、数据阐发，协助客户颁发文章、报告基金，处所名目以及科研结果转化等；

申报引见：

1、卵白代谢国自然名目梳理和思绪引见，卵白代谢名目市场前景阐发；

2、4D-DIA技术引见、试验流程、高分文章研讨思绪和利用；

3、GC-MS和LC-MS双平台技术引见、试验操作、案例展现；

4、多组学技术结合阐发思绪；

报名方式：

1.存眷鹿明生物"大众号；

2.长按扫描下方“小鹿老师”二维码增加小鹿老师微信即可收费参加报名

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-DIA 参考文献

平行累积间断碎裂技术与数据非依赖性采集形式相联合

DIA PASEF: parallel accumulation–serial fragmentation combined with data-independent acquisition

颁发期刊：Nature Methods

影响因子：30.822

颁发光阴：2020.11.30

新冠肺炎晚期的免疫克制

Immune suppression in the early stage of COVID-19 disease

颁发期刊：Nature Communications

影响因子：12.121

颁发光阴：2020.11.17

散布式多中间卵白表型阐发成果的稳定一致性支持精准医治研讨

Standardization and harmonization of distributed multi-center proteotype analysis supporting precision medicine studies

颁发期刊：Nature Communications

影响因子：12.121

颁发光阴：2020.10.16

无需光谱库，通过DIA技术完成疾速、深度的磷酸化卵白质组特异位点阐发

Rapid and site-specific deep phosphoproteome profiling by data-independent acquisition without the need for spectral libraries

颁发期刊：Nature Communications

影响因子：12.121

颁发光阴：2020.02.07

通过卵白质组可持重地提醒基于基因组和转录组阐发前列腺癌疾病停顿进程中的偏差

Integrative proteomics in prostate cancer uncovers robustness against genomic and transcriptomic aberrations during disease progression

颁发期刊：Nature Communications

影响因子：12.121

颁发光阴：2018.03.21