临床流行病学S:揭示泌尿生殖系统肿瘤中5hmC的表观调控机制

中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)团队对泌尿生殖系统肿瘤的5hmC表观基因组特征和图谱进行了深入分析，进一步证实了5hmC的全球缺失和区域获得是泌尿生殖系统肿瘤标志性的表观遗传事件。相关研究成果，题目为《5-羟甲基细胞毒素的区域性获得和全球性丧失在泌尿生殖系肿瘤中共存并调控不同的癌基因通路》，发表于2022年9月20日的《临床表观遗传学》杂志。

本研究采用敏感的基于沉淀的方法(hMeDIP-seq)分析了5hmC在泌尿生殖系统(包括前列腺、尿路上皮和肾脏)肿瘤发生过程中的变化，证实了5hmC在泌尿生殖系统组织中的组织特异性分布，并证实了5hmC在泌尿生殖系统肿瘤中存在区域性增加和整体水平下降，且区域性增加的基因富含调节干燥和缺氧的基因，这些基因均与不良临床预后有关。与传统的二维(2D)刚性培养皿相比，发现软纤维蛋白凝胶诱导的3D肿瘤球中的细胞具有肿瘤干细胞样表型，并且在两种前列腺癌细胞系22RV1和PC3中5hmC的水平增加。通过组合在3D系统中培养的细胞和组织的富含5hmC的基因，定义了癌症干细胞样细胞的恶性特征，其可以预测最差的临床结果并确定来自前列腺癌肿瘤的表型恶性细胞群。值得注意的是，抗氧化剂维生素C衍生物抗坏血酸磷酸镁可以恢复5hmC，引起前列腺癌细胞系凋亡，从而杀死癌干细胞样细胞。前列腺癌的表观遗传分化可以用5hmC重编程药物维生素c治疗。