我国迷信家完成“龙井43”基因组组装和群体重测序

茶树（Camellia sinensis）来源于中国而风行于世界，世界茶饮料花费生齿已超越三分之二。茶树在我国散布普遍，种质资本丰厚，六年夜茶类各具特点，而有关茶树退化的研讨尚少。

2020年9月7日，Nature Communications在线揭橥了中国农业迷信院茶叶研讨所和中国农业迷信院深圳农业基因组研讨所 （以下简称基因组所） 主导并联袂中国迷信院昆明植物研讨所 （以下简称昆明植物所） 及云南省农业迷信院茶叶研讨所等单元完成的题为Population sequencing enhances understanding of tea plant evolution的研讨论文，报道了该协作团队在茶树全基因组组装和茶树来源演变研讨上获得的主要冲破。研讨成果为茶树研讨和育种研讨，以及茶树和退化研讨供给了丰厚的素材。

研讨团队起首以我国有名的茶树种类‘龙井43’ （C. sinensis var. sinensis cv. Longjing 43） 为资料，应用自立开辟的WTDBG三代组装联合Hi-C等技巧，克制了其基因组高度杂合、反复序列比例高 （ 80%） 等庞杂基因组组装难题，完成了‘龙井43’染色体级其余基因组组装。其基因组年夜小为3.26 Gb， scaffold N50到达143.85 Mb，具有较好的持续性，在单碱基程度和scaffold程度都到达了较高的精确性，取得了33556个高质量的正文基因。

研讨发明‘龙井43’与抗病、风味代谢和自交不亲和相干基因家族产生扩大，与抗逆等相干基因产生正选择。基于组装的高质量基因组，对来自世界分歧国度和地域的139份有代表性的茶树资料停止了深度重测序，研讨成果提醒了茶树群体的零碎产生关系，描画了栽培茶树的退化汗青。此外 ，茶树近缘种群是茶变种 （C. sinensis var. sinensis） 和阿萨姆变种 （C. sinensis var. assamica） 的祖先，驯化进程中二者的选择偏向存在差别，茶变种在驯化进程中与风味相干的萜烯类代谢基因和抗病相干基因遭到选择强于阿萨姆变种茶树。

告白美男老婆外出，只剩下我和岳母在家，暴雨夜岳母忽然叫我！

中国小叶种茶树中与萜烯代谢相干的基因遭到选择，而且这些基因在芽和叶中表达量较高。

据悉，本年适逢‘龙井43’这一全国绿茶主产区推行面积居于前列的无性系茶树种类育成60周年。该研讨成果说明了‘龙井43’质优、抗逆的分子实质，具有较好的留念意义。

中国迷信院院士钱前研讨员对研讨团队和该项任务都赐与了高度评价，他说到：“感激茶叶所杨亚军老所长率领的参与该项目研讨的全部茶叶科研人员历久艰难任务，恰是你们继续的研讨积聚和对新建的农业基因组研讨所以阮珏为代表的年老科研人员的信赖，勾结协作，勇攀岑岭，才有了昔日之龙井43基因组研讨之硕果，而龙井43则是中国古代茶叶最典范代表！我很快乐，也很打动，龙井43的茶叶基因组必将奠基古代绿茶育种根底，促使绿茶育种发生新的飞跃！”

该论文的配合一作为茶叶所王新超研讨员、基因组所博士研讨生冯虎、基因组所常玉晓研讨员、茶叶所马春雷副研讨员、茶叶所王丽鸳研讨员和茶叶所郝希望副研讨员；配合通信作者为茶叶所杨亚军研讨员、基因组所阮珏研讨员、茶叶所陈亮研讨员和昆明植物所王国栋研讨员。基因组所李阿伦、崔鹏研讨员、王晓波、艾成、赵胜和吴志超，茶叶所成浩研讨员、王璐副研讨员、金基强副研讨员和韦康研讨员，云南省农业迷信院茶叶研讨所刘本英研讨员和李友勇副研讨员也介入了研讨任务。

该研讨获得中国农业迷信院农业科技立异工程、农业基因组协同立异项目、浙江省茶树新种类选育严重科技专项、深圳市学科规划项目、国度青年拔尖人才支撑筹划和云南省立异研讨团队等项目赞助。(100yiyao.com）