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Nat Commun:新研讨匆匆进癌症的诊断

2021年1月28日讯/100医药网BIOON/---加利福尼亚年夜学欧文分校引导的一项新研讨发现了一种辨认生物标记物的新办法,可以帮忙晚期癌症诊断。这项研讨的重点是肺癌,然则这种被称为“细胞异质性调整的甲基化甲基化(CHALM)”办法也已针对苍老和阿尔茨海默氏病进行了测试,无望用于研讨其他疾病。

“咱们发现CHALM办法能够是帮忙研讨职员从基于序列的甲基化数据中鉴定出更靠得住的差别甲基化基因的有代价的对象,”格雷斯·贝尔(Grace B. Bell)主席,生物信息学传授Wei Li说。 “关于临床大夫来说,这种办法可以帮忙他们辨认更多有用的生物标志物,从而帮忙癌症诊断,这是传统的办法所疏忽的。”

(图片起源:Www.pixabay.com)

该研讨颁发在《Nature communications》杂志上,题目为“Cellular Heterogeneity-Adjusted cLonal Methylation (CHALM) improves prediction of gene expression”,研讨提醒了从测序数据盘算DNA甲基化程度时思索细胞异质性的紧张性。

“将咱们的CHALM办法利用于肺癌数据集之后,咱们可能鉴定出更靠得住的且与生物学功效相关的差别甲基化基因。利用咱们的CHALM办法能够会招致更好的晚期癌症检测,”Li说。

通过使用传统的办法辨认癌症生物标志物,基因表白与启动子甲基化之间的相关性往往较弱,尤其是关于甲基化水平较低的基因而言。这项新研讨发现CHALM办法可以更靠得住地鉴定传统办法无奈检测到的甲基化标志。(100医药网 100yiyao.com)

资讯出处:

原始出处:Jianfeng Xu et al, , Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-020-20492-7

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