Nat Commun：肠道微生物互相作用机制

2021年3月2日讯/100医药网BIOON/---人类的肠道由简单的微生物群落构成，微生物群落耗费并排泄数百个小分子，这种征象称为穿插进食。然而，通过试验研讨这些进程是具备挑战性的。颁发在《Nature Communication》杂志上的一项新研讨使用模子预测肠道中微生物物种之间的穿插进食互相作用。这种盘算办法的预测终极可以帮忙大夫更全面地相识肠道安康。

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肠道的微生物群落或微生物组已知会影响人类安康。先前的研讨集中在确定存在的微生物的类型上。可怜的是，这些信息不敷以相识微生物组。

生物工程学传授，布利斯年夜学传授谢尔盖·马斯洛夫说：“肠道情况是由被称为代谢产品的小分子造成的，这些小分子由微生物群落排泄。虽然可以通过试验丈量这些代谢产品，但它既费事又低廉。”

研讨职员此前颁发过一项研讨，此中他们使用其他研讨的试验数据来模拟代谢产品通过肠道微生物组时的命运。在这项新研讨中，他们使用雷同的模子来预测曩昔尚未确定的新微生物进程。

麻省理工学院的博士后研讨员，马斯洛夫试验室的单干者Akshit Goyal说：“咱们吃的器械间接进入咱们的肠道，而且开释出一系列代谢产品的微生物。生物学家曾经丈量了人类粪便中的这些分子，咱们证实可以使用盘算模子来预测此中一些的程度。”

丈量每种代谢物并试图相识哪种微生物能够开释出的微生物能够具备挑战性。 Goyal说：“存在年夜量能够的穿插进给互相作用。使用这种模子，咱们可以通过预测肠道中更能够产生哪些互相作用来辅助试验。”

该模子还获得了基因组正文的支持，这些正文解释了哪些微生物基因担任加工代谢产品。 Veronika Dubinkina博士说：“咱们对建模预测充斥信念，由于咱们还查看了微生物是否包括进行相关反馈所必须的基因。约有65％的预测获得了这一信息的支持。”

研讨职员正在尽力通过包括更多试验数据来改良模子。 “分歧的人具备分歧的肠道微生物菌株。虽然这些分歧的菌株具备许多独特的基因，但它们的功效却有所分歧。咱们必要从患者那边搜集更多半据，以相识分歧宿主中分歧微生物群落的行动。”（100医药网 100yiyao.com）

资讯出处： 原始出处：Akshit Goyal et al, Nature Communications (2021). DOI: 10.1038/s41467-021-21586-6