高精度亚洲猪参考基因组图谱绘制实现 |
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近日,中国农业迷信院北京畜牧兽医研讨所植物基因工程与种质立异科技立异团队结合北京相关生物企业等单元胜利绘制了梅山猪高质量基因组图谱。该图谱是迄今为止精度最高的亚洲猪基因组图谱,为我国处所猪种质资本维护和开辟应用奠基了根底。相关结果颁发于《分子生态资本(Molecular Ecology Resources)》。
据名目担任人周荣博士引见,我国处所猪种具备肉质好、抗逆性强、耐粗饲等特色,是生猪种业继续立异和完成种源自立可控的优越素材。国际外学者针对我国处所猪种的抗病力、繁衍性能等紧张经济性状的机制展开了年夜量研讨,发生了海量重测序、转录组数据,阐发研讨这些数据必要与参考基因组进行比对,但今朝猪功效基因组学研讨年夜多应用东方猪种杜洛克的基因组序列,这在一定水平下限制了对亚洲家猪的研讨。
研讨职员胜利绘制了我国处所种类梅山猪的高质量基因组图谱,contig N50和scaffold N50别离到达48.05 Mb和138.97 Mb,基因组年夜小为2.51Gb,共正文到22,074个编码基因,是今朝完全度最高、间断性最强的亚洲猪基因组图谱。研讨职员对梅山猪和杜洛克猪的基因组进行了比拟阐发,发现梅山猪基因组共存在49103个构造变异,此中4.02%是亚洲猪特有的构造变异。研讨还发现亚洲猪X染色体上存在一个30 Mb的特有构造变异热门,该热门富集了与亚洲猪脂肪堆积、高繁衍力等特同性表型相关的基因。(100yiyao.com)
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