Narure子刊:人类胎盘在安康和疾病中的RNA景观 |
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2021年5月20日讯/BIOON/---剑桥年夜学在Nature communication杂志上颁发了题为公众The RNA landscape of the human placenta in health and disease"大众的文章。人类胎盘在安康和疾病中的RNA景观。在这里,作者申报了高质量的RNA-Seq数据,并提供了对人类胎盘转录组的全面阐发。
图片起源:https://doi.org/10.1038/s41467-021-22695-y
在哺乳植物发育进程中,胎盘是第一个造成的器官,担任将胚胎固定在子宫上,并介导与母亲的养分和蔼体互换。胎盘在整个妊娠时代支持胎儿,胎盘缺点是许多妊娠并发症的本源。然而,虽然胎盘对退化、发育和具备紧张意义,但对胎盘的研讨还不够充沛,通常在年夜规模的"大众组学"大众阐发中被省略。例如,在基因类型-组织表白(GTEx)名目中的17382个样本中,没有一个是胎盘的,这是一项组织范畴的基因表白研讨。然而,胎盘功效阻碍是孕产妇和围产儿发病率和灭亡率的次要起因。活着界范畴内,孕产妇和围产期灭亡形成的灭亡负担相称于癌症形成的总负担的一半左右。
RNA除了编码卵白质外,还具备许多功效。例如,它们在细胞核和细胞质中都饰演着调理转录的多重脚色。它们节制核构造,调理mRNA的稳定性、翻译和翻译后修饰。是以,相识今朝存在的RNA谱系,有助于咱们懂得细胞和组织的功效。
先前的胎盘转录组阐发集中在与母体和胎儿状况相关的差别上。最初的研讨使用了微阵列阐发,随后是比来的RNA-Seq。然而,这些研讨在胎盘活检的数目和测序报道的深度方面是无限的。此外,晚期的RNA-Seq研讨年夜多使用寡聚dT启动的cDNA合成,这障碍了非腺化RNA的阐发,并针对microRNA(MiRNA)和PIWI互相作用RNAs(PiRNAs)等小转录本进行了选择。
胎盘RNA转录本的简单性
图片起源:https://doi.org/10.1038/s41467-021-22695-y
作者从302团体胎盘中拆散出总RNA,按年夜小分级,并对耗尽的长RNA和小RNA进行了测序。起首描写了胎盘中分歧类型的转录本,并与其别人类组织相比,阐发了转录组的构成和简单性。然后,然后作者重修了胎盘转录组,并申报了之前无奈辨认的编码和非编码转录本。作者发当初子痫后期(PE)和胎儿成长受限(FGR)病例中存在多种丰厚的环状RNA(CircRNAs),并提供了异常转录本的阐发。末了,作者证实母体血清中一种由差别表白的mRNA编码的卵白质--叶状素样卵白3(FSTL3)的程度可以预测PE和FGR。
总之,在本研讨中,作者申报了高质量的RNA-Seq数据,并对人类胎盘转录组进行了全面阐发。(100医药网 100yiyao.com)
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