昆明植物所颁发人类病毒组多样性变动模子 |
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病毒在人体内以病毒群落模式存在,这些病毒群落的聚拢即为人类病毒组(Human Virome)。与肠道菌群中的细菌相比,病毒数目是细菌数目的10倍以上。人类病毒群落包含内源性逆转录病毒、感化人类细胞的真核病毒、感化的噬菌体和感化古菌的病毒。人体病毒群落与宿主间存在协同退化,因而存在着简单的互相作用。现有研讨发现,人体病毒组与许多疾病间存在慎密分割,疾病能够影响病毒组的多样性以及病毒构成,同时病毒组的改动也影响疾病的发病和过程。这些疾病不仅包含病毒源性的疾病,即由病毒感化间接引发的疾病,例如艾滋病、埃博拉出血热和风行性伤风等,还包含非病毒源性疾病,例如囊性纤维化、牙周疾病、炎症性肠病等。
近期,中国迷信院昆明植物研讨所盘算生物与医学生态学科组博士研讨生肖琬蒙利用研讨员马占山先条件出的“多样性-面积关系”(Diversity-Area Relationship, DAR系对经典 SAR(Species-area relationship)的扩大)阐发办法,初次得到了人类病毒群落多样性在个别间的异质性、群体程度的潜在多样性、以及“局部病毒群落”(例如单团体体病毒组)多样性在“环球病毒宏群落”(例如一地域人群)中所占的比值(Ratio of local diversity to global diversity, LGD),并探求了疾病对这些参数的影响。研讨发现,疾病对人类病毒群落在个别间多样性、异质性的影响通常不显着,而潜在病毒多样性在安康对照与患者间能够存在显着差别;人体病毒群落的LGD参数弘远于细菌群落。上述发现提示,虽然人体体内病毒个别数目是细菌数目10倍,但从群体角度看,团体对环球病毒多样性奉献比对多样性的奉献高。
相关研讨结果以Inter-Individual Diversity Scaling Analysis of the Human Virome with Classic Diversity-Area Relationship (DAR) Modeling为题,在线颁发在Frontiers in Genetics上。肖琬蒙为论文第一作者,马占山为论文通信作者。研讨任务获得国度自然迷信基金、遗传资本与退化国度重点试验室以及中科院植物与退化穿插立异杰出中间的支持。(100yiyao.com)
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