UCSD研讨职员应用AI技术发现新DNA启动码 |
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近日,加州年夜学圣地亚哥分校(UCSD)研讨职员在《自然》杂志上颁发研讨,引见其使用人工智能技术发现了新的DNA启动码“上游焦点启动子区”(downstream core promoter region-DPR),无望在生物技术和生物医学利用畛域用来节制基因启动。
据研讨职员引见,DNA接管到A、C、G、T这4种碱基的编码指导后收回准确指令,人类基因收到指令后被激活采用行为。今朝已知,近25%的基因都是由TATAAA相似序列(即“TATA框”)进行转录的,但因为DNA碱基序列能够性十分多,剩下75%的基因是若何启动的始终是个谜。
研讨职员对50万个随机DNA序列的DPR运动进行了评价,挑选出此中20万个序列天生了一种可能准确预测人体DNA中DPR运动的机械培训模子,此外还制造了一个可能辨认TATA框序列的相似机械培训模子。研讨职员使用新模子对数千个已知TATA框和DPR运动环境的测试样本进行评价后发现,其预测才能“十分棒”。研讨成果显示,人类基因中确切存在DPR运动,且其产生率与TATA框相称。据研讨作者、UCSD生物迷信系特聘传授角川引见称,DPR可能启动约1/4至1/3的基因。此外,研讨职员还发现,DPR和TATA框之间存在一种巧妙的二元性,TATA框序列启动的基因短少DPR序列,反之亦然。
角川表现,DPR此前之以是未被发现是由于其不具有显而易见的序列形式,暗藏在DNA序列中的加密信息使之具有DPR属性,人类无奈破译这一信息,但机械培训模子可以。使用人工智能对DNA序列形式进行阐发应该可以提升研讨职员对人体细胞中基因启动的懂得和节制。(100yiyao.com)
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