Science子刊:开辟出一种检测新冠病毒RNA的双色RT |
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2020年9月28日讯/BIOON/---新型冠状病毒SARS-CoV-2招致2019年冠状病毒病(COVID-19),现在正在全球暴虐。基于此,人类面对着一项严重的公共卫生挑衅。疾速检测现有的SARS-CoV-2沾染和评价病毒传达至关主要。
基于逆转录环介导等温扩增(reverse transcription loop-mediated isothermal amplification, RT-LAMP)检测病毒RNA的办法有潜力成为复杂、可扩大和普遍实用的检测办法。与基于逆转录定量聚合酶链反响(RT-qPCR)的办法比拟,RT-LAMP检测须要在恒温下孵育,是以无需庞杂的仪器装备。
在一项新的研讨中,来自德国沾染研讨中间、德国癌症研讨中间和海德堡年夜学的研讨人员应用了一组针对SARS-CoV-2 N基因的引物测试了用于检测SARS-CoV-2病毒RNA的双色RT-LAMP检测计划。相干研讨成果近期揭橥在Science Translational Medicine期刊上,论文题目为“A colorimetric RT-LAMP assay and LAMP-sequencing for detecting SARS-CoV-2 RNA in clinical samples”。
图片来自Science Translational Medicine, 2020, doi:10.1126/scitranslmed.abc7075。
这些作者从正在承受COVID-19测试的个别的768份咽拭子样本中获取过剩的RNA样本,并对这些样本停止RT-LAMP检测。他们测定了应用RT-LAMP检测SARS-CoV-2病毒RNA的敏锐度和特异性。
与应用一组高敏锐的引物的RT-qPCR检测办法比拟,这些作者发明RT-LAMP检测办法能靠得住地检测RT-qPCR测试时轮回阈值(Ct)不超越30的SARS-CoV-2 RNA,敏锐度为97.5%,特异性为99.7%。
这些作者还开辟了一种不须要事前停止RNA别离步调的咽拭子直接RT-LAMP(swab–to–RT-LAMP)检测办法,它保存了优秀的特异性(99.5%),但比RT-LAMP检测的敏锐度低(对RT-qPCR测试时Ct 30的咽拭子样本而言,敏锐度为86%)。此外,这些作者开辟了一种多重测序办法(LAMP-sequencing, LAMP测序)作为验证法式,以检测和记载RT-LAMP反响的成果。(100医药网 100yiyao.com)
参考材料:
Viet Loan Dao Thi et al. . Science Translational Medicine, 2020, doi:10.1126/scitranslmed.abc7075.
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