Science：新研讨组装出改良的恒河猴参考基因组

2020年12月20日讯/BIOON/---在一项新的研讨中，一个来自美国、意年夜利和德国的年夜型研讨团队改良了对恒河猴参考基因组的组装。相关研讨成果颁发在2020年12月18日的Science期刊上，论文题目为“Sequence diversity analyses of an improved rhesus macaque genome enhance its biomedical utility”。在这篇论文中，他们描写了使用先进的测序技术来构建恒河猴参考基因组，以及为什么他们以为这种新的参考基因组将对医学迷信家如斯紧张。

图片来自Science, 2020, doi:10.1126/science.abc6617。 正如这些研讨职员所指出的那样，因为恒河猴的生物学特征与人类的生物学特征堆叠，是以恒河猴是医学迷信中最常研讨的植物模子。例如，通过对恒河猴的研讨，人们更好地相识了HIV病毒，以及若何医治感化了HIV病毒的人。在展开与埃博拉疫苗相关的任务中，以及在开辟医治神经体系疾病的疗法中，该物种也发扬了很年夜的作用。他们还指出，此类研讨始终依赖于2007年以来的恒河猴基因组数据。他们进一步指出，用于基因组测序的技术在过来十年中获得了极年夜的改善，是以改良恒河猴参考基因组的时机仿佛曾经成熟。

这项研讨波及使用该畛域的最新对象来进步附近性（contiguity）--在这项研讨中，进步了120倍。这些研讨职员还使用650万个全长转录本对基因组进行正文。此外，他们还对853只实验恒河猴的组织样本进行了全基因组测序，发现了年夜约1050万个拔出或缺失（indel）变体--以及近8600万个单核苷酸变体。他们以为，这类变体（尤其是那些由毁伤招致的变体）可以被医学专家用来更好地相识人类自闭症和其他基于神经体系的发育疾病的性子。他们还填补了先前基因组序列中存在的年夜约99.7%的空缺。

成果便是为恒河猴组装出新的参考基因组，它远远优于任何其他现有的参考基因组。这些研讨职员冀望新的参考基因组能在将来的医学研讨中发扬紧张作用。（100医药网 100yiyao.com）

参考材料：

1.Wesley C. Warren et al. . Science, 2020, doi:10.1126/science.abc6617.

2.A better reference genome for the rhesus macaque

https://phys.org/news/2020-12-genome-rhesus-macaque.html