不结球白菜基因组研讨取得紧张停顿

南京农业年夜学侯喜林传授团队在不结球白菜研讨中取得紧张停顿，相关结果以“A chromosome-level reference genome of non-heading Chinese cabbage [Brassica campestris（syn. Brassica rapa） ssp. chinensis]”颁发于Horticulture Research上。该结果颠末10多年的深化研讨，提醒了不结球白菜维生素C和硫代葡葡糖苷养分物资的代谢机制，为低劣性状分子设计育种奠基了松软根底。同时也为国际外同业提供了不结球白菜的高程度参考基因组数据。

不结球白菜，俗称青菜、小白菜，原产中国，是最受年夜众青睐的蔬菜之一，栽培面积由2005年的800万亩回升到当初的2，100万亩左右，已成为我国第三年夜蔬菜作物。该研讨以不结球白菜‘姑苏青’为资料，应用最新的测序伎俩，得到396.83Mb近完全的高质量的染色体级基因组，并对其功效进行正文，其ContigN50 2.83Mb。此基因组质量高于现有其它白菜基因组。依据这一新基因组，研讨发现反复序列占全基因组的比例约为53%，而且正文获得了48，158个卵白质编码基因。比拟基因组阐发证明，不结球白菜阅历了一个与其他十字花科物种共享的全基因组三倍化（WGT）变乱，这产生在与拟南芥共享的WGD变乱之后，为研讨芸薹属芸薹种亚种之间分解提供紧张的根据。对维生素C和硫代葡萄糖苷（GSLs）合成和代谢路径相关基因进行了鉴定和比拟阐发，获得了串联复制招致的基因拷贝数变异，而且GSL基因在白菜基因组中产生了高度扩张。结合转录组阐发，对相关基因的表白进行了探求，提醒了不结球白菜维生素C和硫代葡葡糖苷养分物资的代谢调控机制。

本项研讨任务以作物与种质立异国度重点试验室/农业乡村部华东地域园艺作物生物学与种质创制重点试验室/园艺作物种质立异与应用教育部工程研讨中间为第一单元，百迈客生物科技无限公司为第二单元。南京农业年夜学园艺学院侯喜林传授为该论文的通信作者，李英传授和刘岑岭博士后为等同奉献第一作者，南京农业年夜学刘同坤、张昌伟副传授，肖栋、陈飞讲师和百迈客生物科技无限公司的马立明、郑洪坤参加了该研讨任务。本项研讨获得了国度重点研发筹划（2016YFD0101701）、国度年夜宗蔬菜家当技术系统（CARS-23-A-06）、国度自然迷信基金（31872106）和国度青梗菜劣种严重科研结合攻关名目（111821301354052283）的赞助。(100yiyao.com）