复旦邵志敏团队绘制出迄今最大的三阴性乳腺癌代谢组图 |
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来源:奇点蛋糕2022-02-25 12:48
TNBC的雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体2(HER2)均为阴性,约占所有乳腺癌的15%。与激素受体阳性或HER2阳性乳腺癌相比,TNBC不仅恶性程度更高,复发转移风险更大,而且缺乏积极有效的治疗手段,如内分泌治疗和抗HER2治疗[1]。因此,迫切需要在TNBC找到潜在的有效治疗靶点。2019年,来自复旦大学附属肿
三阴性(TNBC)雌激素受体、孕激素受体和人类表皮生长因子受体2(HER2)均为阴性,约占所有乳腺癌的15%。与激素受体阳性或HER2阳性乳腺癌相比,TNBC不仅恶性程度更高,复发转移风险更大,而且缺乏积极有效的治疗手段,如内分泌治疗和抗HER2治疗[1]。因此,迫切需要在TNBC找到潜在的有效治疗靶点。
2019年,复旦大学附属医院乳腺外科邵志敏教授团队在绘制TNBC基因组和转录组图谱时,将TNBC分为免疫调节(IM)、腔内雄激素受体(LAR)、基础免疫抑制(BLIS)和间质性(MES)四个亚型,并为每个亚型确定了一些潜在的治疗靶点[2]随后,研究团队对发现的靶点进行了“未来”验证结果显示,虽然精准治疗显著提高了复发转移TNBC的治疗有效率,但仍有部分靶点未能达到预期疗效,如LAR亚型和BLIS亚型,疗效相对较差[3]。
近日,邵志敏教授和江一舟教授团队在前期研究的基础上,再次成功绘制了世界上最大的TNBC代谢组图谱。这一重要研究成果发表在著名期刊《细胞研究》上。
作为TNBC基因组和转录组图谱的延续,该研究优化了以往的分类标准,提出了三种新的代谢分类:富含鞘脂型、氧化代谢物和糖基化代谢物富集型和低代谢紊乱型[4]。
此外,研究还对目前无效的LAR亚型和BLIS亚型的代谢产物进行了分析,发现了两个新的潜在靶点:鞘氨醇1-磷酸(S1P)和N-乙酰-天冬氨酰-谷氨酸(NAAG),为进一步了解TNBC的代谢异质性和精准个体化治疗提供了新的方向和策略。
能量代谢重编程作为细胞最显著的特征之一,明显不同于正常细胞。TNBC的代谢基因特征在不同样品中也有显著差异。在之前的研究中,邵志敏教授团队利用多种算法,根据代谢基因的特点,将TNBC分为三种代谢亚型:脂质合成型、糖酵解型和混合型[2]。
鉴于TNBC明显的代谢紊乱,邵志敏教授和江一舟教授团队决定进一步探索TNBC的代谢物特征。
研究团队检测了330份TNBC组织样本和149份相应正常乳腺组织中的极性代谢组和脂质代谢组(包括594种极性代谢物和1944种脂质),发现TNBC的代谢组特征:磷脂、鞘脂等脂质显著上调,糖基化相关代谢物积累。
具体分析结果显示,肿瘤和正常样品的代谢物丰度存在显著差异。在极性代谢物中,与氧化和糖基转移有关的代谢物(如氧化型谷胱甘肽[GSSG]和尿苷二磷酸葡萄糖[UDPG])在肿瘤组织中显著富集。脂质,如磷脂酰肌醇、脂肪酸和神经酰胺,在肿瘤组织中富集。基于京都基因和基因组百科全书(KEGG)中代谢途径的差异丰度(DA)分析,发现大量参与甘油磷脂代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢途径的代谢物表现出较高的DA分数。
在TNBC和正常组织之间不仅存在显著的代谢差异,而且在TNBC也存在显著的代谢异质性。根据代谢产物的特征,TNBC可分为三种不同的代谢组学亚型:C1型富含鞘脂,以富含神经酰胺和脂肪酸为特征;C2型富含氧化代谢产物和糖基化代谢产物,其特点是氧化反应和糖基化转移相关代谢产物上调。C3型是低代谢紊乱,其特征是最低水平的代谢紊乱。
在能量代谢方面,C1肿瘤富含长链不饱和脂肪酸,可能更依赖于脂肪酸代谢。C2肿瘤在谷氨酸途径的代谢产物相对丰富,可能更依赖于谷氨酸代谢。C3型的代谢组学差别不大。
基于TNBC基因组和转录组特征的前期数据,研究人员将其与本次代谢组学数据相结合,发现TNBC最常见的PIK3CA突变与脂肪酸丰度正相关,而与GSSG丰度负相关。这与报道的PIK3CA突变驱动脂肪酸过量产生的结果一致[5]。
此外,研究人员还发现,这三种代谢组学亚型与之前定义的四种转录组亚型相关:转录组中的LAR亚型几乎与代谢组学组中的C1亚型重叠。BLIS亚型包括在C2和C3亚型中。考虑到LAR和BLIS亚型患者的治疗效果在未来的试验中并不理想,研究团队想通过代谢组学的结果在LAR和BLIS亚型中寻找潜在的治疗靶点。(100yiyao.com)
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